PLBD包含描述蛋白質(zhì)-小分子化合物（配體）相互作用的熱力學(xué)和動(dòng)力學(xué)數(shù)據(jù)。熱力學(xué)參數(shù)不僅包括親和力，還包括結(jié)合標(biāo)準(zhǔn)焓的變化。相互作用的化合物是多種多樣的，但通常通過(guò)藥效基團(tuán)相關(guān)，該藥效基團(tuán)控制與一系列高度相關(guān)的蛋白質(zhì)、同工酶或突變體的相互作用。PLBD主要研究?jī)深惖鞍踪|(zhì)，人類Carbonic Anhydrase和熱休克蛋白。
       該數(shù)據(jù)庫(kù)旨在成為科學(xué)家尋找和存儲(chǔ)蛋白質(zhì)-配體相互作用的熱力學(xué)、動(dòng)力學(xué)和結(jié)構(gòu)參數(shù)的通用平臺(tái)。PLBD描述了與共晶結(jié)構(gòu)結(jié)合的熱力學(xué)參數(shù)，這將有助于用于治療目的的新型化合物的計(jì)算機(jī)設(shè)計(jì)。
       https://plbd.org/db/

       從數(shù)據(jù)庫(kù)結(jié)構(gòu)上講，PLBD由數(shù)據(jù)表（樣本、實(shí)驗(yàn)和其他）和視圖組成。視圖顯示從主數(shù)據(jù)表派生的計(jì)算參數(shù)和其他信息。如下圖所示，箭頭表示結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)單元之間信息交換的方向。

• Protein- Compound

       第一組表格描述了化合物和重組蛋白。關(guān)于蛋白質(zhì)和化合物的信息在與其對(duì)應(yīng)批次的單獨(dú)表格中列出

       點(diǎn)擊“Protein”跳轉(zhuǎn)至詳情頁(yè)，展示包括蛋白ID、來(lái)源樣本、蛋白氨基酸序列在內(nèi)的信息：

       點(diǎn)擊“Protein label”跳轉(zhuǎn)至特定蛋白詳情頁(yè)：

• Experimental

       實(shí)驗(yàn)表以多對(duì)一的方式與批次表相關(guān)，批次表也與蛋白質(zhì)和化合物表呈多對(duì)一關(guān)系，這意味著每個(gè)結(jié)合實(shí)驗(yàn)將與單個(gè)批次的蛋白質(zhì)和配體相關(guān)。

       點(diǎn)擊實(shí)驗(yàn)中的任意一項(xiàng)實(shí)驗(yàn)，跳轉(zhuǎn)至詳情頁(yè)：

• intrinsic parameters

       這組表格包含蛋白質(zhì)與化合物（配體）相互作用的熱力學(xué)和動(dòng)力學(xué)數(shù)據(jù)。

       根據(jù)用于確定特定相互作用的技術(shù)，實(shí)驗(yàn)測(cè)量的參數(shù)列在單獨(dú)的表格中：TSA、ITC、SFA和SPR。除此之外，數(shù)據(jù)庫(kù)還包含蛋白質(zhì)和配體質(zhì)子化參數(shù)表（pKa和?Ha）。