乳腺癌的轉移和耐藥已成為成功治療患者的障礙。lncRNAs被認為是癌癥發生和發展的重要參與者。LncRNA BCAR4在乳腺癌患者組織和血漿中顯著升高，并在乳腺癌細胞系中上調。BCAR4上調與TNM分期相關，手術切除乳腺腫瘤后BCAR4下調。BCAR4的沉默抑制了乳腺癌細胞的集落形成、遷移、侵襲和異種移植瘤的生長，并促進了化療敏感性。在機制上，BCAR4通過MAPK通路的miR-644a-CCR7軸促進乳腺癌的遷移和侵襲。BCAR4通過與miR-644a結合并下調miR-644a，間接促進ABCB1表達，誘導乳腺癌化療耐藥。我們的發現為BCAR4的致癌作用提供了見解，并暗示BCAR4作為一種潛在的診斷生物標志物和一種有前途的治療藥物，可以抑制乳腺癌的轉移和抑制化療耐藥。本文于2023年1月發表于“Journal of Experimental & Clinical Cancer Research”（IF=12.658）上。

技術路線

結果

1）BCAR4在乳腺癌組織和血漿樣本中顯著上調

我們從TCGA數據庫和StarBase V3.0中檢測了BCAR4在乳腺癌組織中的表達。在TCGA數據庫中，BCAR4在1097個乳腺癌組織中表達高于114個非癌性乳腺組織(圖1A)。在StarBase V3.0中觀察到類似的結果(圖1B)。接著，我們檢測了80例乳腺癌患者和80例健康對照組的血漿樣本中BCAR4的表達水平，發現乳腺癌血漿樣本中BCAR4水平明顯升高(圖1C)， III期和IV期的BCAR4水平明顯高于I期和II期(圖1D)。此外，我們分析了20對乳腺癌患者術前和術后血漿樣本。術后血漿樣本中BCAR4水平顯著降低(圖1E)。最后，我們檢測了BCAR4在不同乳腺癌細胞中的表達。BCAR4在MDA-MB-231和MCF-7中均有高表達(圖1F)，因此我們選擇了這兩個細胞系進行后續實驗。這些結果表明BCAR4在乳腺癌腫瘤和血漿樣本中顯著上調。

2）BCAR4的下調抑制乳腺癌的遷移、侵襲和DOX耐藥

為探討BCAR4在乳腺癌中的作用，將BCAR4 siRNA轉染MCF-7和MDAMB-231細胞。RT-qPCR檢測顯示，BCAR4 siRNA (si-1#、si-2#和si-3#)顯著抑制BCAR4的表達，其中si-2#的抑制作用最大(圖2A和E)。Transwell檢測顯示si-2#降低了MCF-7和MDA-MB-231細胞的遷移和侵襲(圖2B、C、D、F、G和H)。傷口愈合實驗表明，抑制BCAR4可減少乳腺癌細胞的遷移(圖2I和J)。si-2#可顯著減少乳腺癌細胞中的菌落數量(圖2K和L)。此外，抑制BCAR4可降低MCF-7和MDA-MB-231細胞中DOX的50%抑制濃度(IC50)(圖2M和N)。western blot檢測顯示，抑制BCAR4可下調ABCB1和兩種間充質標志物(Vimentin和VEGF)的表達，并上調上皮標志物E-cadherin的表達(圖2O)。綜上所述，這些結果支持BCAR4的下調可抑制乳腺癌細胞的遷移、侵襲、化療耐藥、還有潛在的上皮-間質轉化。

3）BCAR4下調miR-644a的表達

為了研究BCAR4促進乳腺癌進展的潛在機制，我們尋找了與BCAR4結合的miRNA。在StarBase V3.0中預測miR-644a會與BCAR4相互作用(圖3A)。HEK-293T、MDA-MB-231和MCF-7中的熒光素酶報告實驗顯示，過表達miR-644a會抑制BCAR4野生型(WT)構建物的熒光素酶活性，但在突變型(MUT，圖3B、D和F)中不會。下調miR-644a會顯著增加WT BCAR4的熒光素酶活性，但在MUT中不會(圖3C、E和G)。BCAR4的下調導致MCF-7和MDA-MB-231細胞中miR-644a顯著上調(圖3H)。此外，80例乳腺癌患者血漿樣本中miR-644a水平低于健康對照組(圖3I)。80例乳腺癌患者血漿中BCAR4和miR-644a的表達呈負相關(圖3J)。與非癌乳腺上皮細胞系HBL-100相比，miR-644a在不同的乳腺癌細胞中也被下調(圖3K)。這些結果表明BCAR4在乳腺癌中直接結合并負調控miR-644a。

4）BCAR4在乳腺癌細胞中通過miR-644a下調促進遷移、侵襲和化療耐藥性

我們用BCAR4 siRNA + miR-644a inhibitor轉染MCF-7和MDA-MB-231細胞。乳腺癌細胞中，miR-644a抑制逆轉了BCAR4沉默導致的集群形成減少(圖4A, B)。傷口愈合和Transwell實驗顯示，共轉染miR-644a抑制劑逆轉了BCAR4 siRNA介導的MCF-7和MDA-MB-231細胞的遷移和侵襲減少(圖4C-4F)。此外，BCAR4沉默降低了細胞活力和DOX的IC50，這在MDA-MB-231細胞中被miR-644a抑制劑逆轉(圖4G)。此外，在MCF-7和MDA-MB-231細胞中，miR-644a抑制劑逆轉了BCAR4抑制導致的ABCB1、Vimentin和VEGF的下調以及E-cadherin的上調(圖4H)。這些結果表明，BCAR4促進乳腺癌細胞的遷移、侵襲和化療耐藥性，至少部分是通過miR-644a的下調實現的。

5）MiR-644a直接靶向CCR7，通過MAPK信號調節遷移和侵襲

我們將miR-644a模擬物和抑制劑引入MDA-MB-231細胞進行功能增益和功能損失研究。集落形成實驗表明，轉染miR-644a mimic的MDA-MB-231細胞形成的集落比對照細胞少。相反，轉染miR-644a inhibitor的MDA-MB-231細胞的菌群數量明顯高于對照細胞(圖5A)。過表達miR-644a顯著抑制細胞遷移和侵襲，而抑制miR-644a則促進細胞遷移和侵襲(圖5B, C)。轉染miR-644a mimic的MDAMB-231細胞存活率和對DOX的IC50降低，而miR-644a inhibitor則顯示相反的結果(圖5D)。根據TargetScan、miRTarBase和miRDB的預測，13個候選基因的3'UTR具有miR-644a結合位點(圖5E)。我們專注于CCR7基因(圖5E)。CCR7及其配體CCL19通過觸發PI3K/AKT、MAPK、JAK/STAT3等多種信號通路，調控乳腺癌細胞EMT進程，促進腫瘤細胞的侵襲和遷移過程。在TCGA數據集中，與非癌性乳腺組織(圖5F)。值得注意的是，CCR7在I期、II期和III期的表達較高(圖5G)。特別是，當將乳腺腫瘤按分子亞型進行分層時，CCR7在腔內、HER2陽性、三陰性腫瘤中的表達明顯高于非癌性乳腺組織(圖5H)。熒光素酶報告實驗結果顯示，miR-644a負向調控CCR7 WT 3’UTR的熒光素酶活性，但對突變體沒有影響(圖5I)。相反，當miR-644a被抑制時，含有野生型3’UTR的HEK-293T細胞中熒光素酶活性明顯升高(圖5J)。在MDA-MB-231細胞中，過表達miR-644a顯著下調ABCB1、Vimentin、VEGF、CCR7、p-ERK和p-p38，上調E-cadherin。抑制miR-644a對這些蛋白水平有相反的影響(圖5K)。此外，在共轉染miR-644a抑制劑的MDA-MB-231細胞中，BCAR4抑制導致的CCR7、p-ERK和p-p38的下調被逆轉(圖5L)。

6）下調BCAR4可減少體內腫瘤的生長和轉移

為了評估BCAR4下調是否會減少體內腫瘤的生長和轉移，我們將MDA-MB-231細胞注射到BALB/c裸鼠的乳腺脂肪墊中。用體內BCAR4 siRNA或對照組治療異種移植腫瘤3周。我們發現，siBCAR4治療小鼠的腫瘤發展比對照組慢(圖6A和B)。肺和肝臟活檢顯示si-BCAR4小鼠的肺和肝臟轉移較少(圖6C和D)。此外，免疫組織化學分析表明si-BCAR4可明顯提高E-cadherin的表達，抑制CCR7、VEGF和Vimentin的表達(圖6E)。這些結果表明，下調BCAR4可通過提高體內CCR7的表達，顯著降低乳腺癌的腫瘤生長和轉移。

結論：

我們發現BCAR4通過miR-644a-CCR7軸和MAPK通路加速乳腺癌的遷移和侵襲。BCAR4還上調ABCB1以誘導乳腺癌的化療耐藥。這些發現表明BCAR4是乳腺癌轉移和耐藥的一個有希望的治療靶點。

參考文獻：

Wu T, Li X, Yan G, Tan Z, Zhao D, Liu S, Wang H, Xiang Y, Chen W, Lu H, Liao X, Li Y, Lu Z. LncRNA BCAR4 promotes migration, invasion, and chemo-resistance by inhibiting miR-644a in breast cancer. J Exp Clin Cancer Res. 2023 Jan 10;42(1):14. doi: 10.1186/s13046-022-02588-8.