腦細胞類型的多樣性是神經元回路的基本組成部分。現代神經科學的一個主要目標是破譯各種類型的細胞組成并表征其特性。由于神經元細胞的高度異質性,直到最近,還不可能以高分辨率對腦細胞類型進行分組。得益于單細胞轉錄組技術,scBrainMap建立了一個針對幾個物種的腦細胞類型和相關遺傳標記的數據庫。該數據庫包含4881種細胞類型。scBrainMap使用戶能夠針對不同的感興趣細胞類型執行定制的、交聯的、生物學相關的查詢。
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Cell types
用戶可以搜索目標基因以找到其潛在信息,也可以選擇物種來篩選標記并查看進一步的信息,還可以使用不同類型的標記基因選擇:
點擊感興趣的物種及其細胞類型后將在頁面下方展示所有結果,接下來可以通過選擇特定的細胞/疾病等信息進行結果篩選:
繼續點擊某一特定細胞類型,將跳轉至該細胞的詳情頁,可以瀏覽該細胞的數據來源、top20的marker基因:
Brain regions
用戶可以選擇感興趣的物種來尋找不同大腦區域的遺傳標記,也可以點擊不同的大腦區域來篩選它們的細胞類型:
以“Human”為例,在圖中點擊感興趣的區域即可在下方顯示細胞類型信息:
Conditions
用戶也可以通過選擇發育階段或疾病類型來尋找遺傳標記:
以“Disease”為例,在左側欄選擇物種后,點擊感興趣的疾病類型,即可瀏覽下撥類型信息: