非編碼RNA(ncRNA)是許多細胞過程中的重要參與者,從正常發育到致癌轉化。最初,ncRNA被定義為缺乏開放閱讀框架(ORF)的RNA轉錄物。然而,多條證據表明,某些ncRNA具有小的開放閱讀框(smORF),可以翻譯成肽(長度小于100個氨基酸)。從生物學角度來看,ncRNA編碼肽(ncPEPs)的生物起源、功能或結構財產是否與編碼區的肽不同尚不確定。ncPEPs的生物發生似乎與其他肽不同,因為它們通常是從獨特的編碼序列smORF翻譯而來的,ncRNA smORF的序列通常以傳統的AUG起始密碼子開始,以非典型的終止密碼子結束。
NcPEPs作為一類新的重要功能分子,有助于維持細胞穩態的各種細胞過程,正逐漸受到人們的重視。功能性ncRNA編碼肽(FuncPEP)數據庫是專門用于實驗驗證和功能表征的ncPEP的數據庫,包括100多種功能性ncPEP以及編碼它們的ncRNA的信息,可以用于ncPEP的生物成因、結構財產和功能。
https://bioinformatics.mdanderson.org/Supplements/FuncPEP/
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