lncRNA參與多樣化生物過程,協調細胞分化,發育和發病機理。lncRNAs失調在癌癥進展中起重要作用,lncRNA的m6A修飾會給它在癌癥中的功能效應帶來何種影響,這篇Journal of Hematology & Oncology文章告訴你答案。
思維路線:
結果:
1. LINC00958在HCC中高表達,可預測總生存率
肝癌中LINC00958的表達明顯升高,尤其是在那些分化中等或較差、微血管侵襲和TNM III /IV期的人中,LINC00958表達高的患者總體生存率較低,回歸分析表明LINC00958是肝癌患者的獨立預后因素。
2.肝癌細胞的惡性行為需要LINC00958
LINC00958主要位于細胞質中,LINC00958的敲低能降低HCCLM3和Focus細胞的增殖能力,遷移侵襲能力明顯減少,過表達促進肝細胞的遷移侵襲能力。這些表明LINC00958在體外促進HCC的增殖和遷移。
3.在肝癌中LINC00958靶向miR-3619-5p以發揮促腫瘤作用
數據庫分析發現六個miRNA與LINC00958具有潛在的互補結合序列,LINC00958-過表達組中miR-3619-5p富集最高,LINC00958在miR-3619 mimics組中的富集度高于對照組。這些表明LINC00958和miR-3619-5p存在于同一RNA誘導的沉默復合物中。miR-3619-5p模擬物降低轉染野生型LINC00958序列的HCC細胞的螢光素酶活性,轉染生物素標記miR-3619-5pHCC細胞中LINC00958增,加HCC細胞的細胞質中有LINC00958和miR-3619-5p的共定位。
4. HDGF是miR-3619-5p的直接靶標,對于LINC00958的功能至關重要
生物信息學分析miR-3619-5p的靶基因,只有肝細胞源性生長因子(HDGF)在LINC00958敲低細胞中下調,并在LINC00958過表達細胞中上調。LINC00958沉默的HCC細胞中進行RNA測序,發現429個基因下調和134個基因上調,HDGF下調顯著,螢光素酶報告基因實驗表明miR-3619-5p模擬物降低了野生型HDGF 3'-UTR螢光素酶的活性,在HCCLM3細胞中,miR-3619-5p模擬物導致HDGF表達水平降低,加入miR-3619-5p抑制劑時HDGF表達水平高。HDGF在肝癌組織中顯著上調,HCC組織標本中miR-3619-5p和HDGF表達水平存在負相關,LINC00958的表達與HDGF表達正相關,HDGF過表達可以挽救被sh-LINC00958抑制的細胞增殖。這些表明HCC中LINC00958 / miR-3619-5p / HDGF軸的促腫瘤作用。
5. LINC00958與肝癌細胞的脂肪生成呈正相關
細胞敲低LINC00958表現出降低的膽固醇和甘油三酸酯水平,過表達LINC00958膽固醇和甘油三酸酯水平較高。LINC00958敲低細胞中脂肪形成中的幾種關鍵酶的mRNA水平下降包括SREBP1,FASN,SCD1和ACC1,過表達正好相反。在HCC細胞中進行了油紅O染色,LINC00958敲低降低了HCCLM3細胞脂滴的數量,LINC00958高水平肝癌患者樣本中檢測到更多的脂滴。
6. LINC00958促進體內HCC生長
LINC00958敲低抑制腫瘤,過表達加速腫瘤生長。HDGF的表達水平在sh-LINC00958組中下調,并在LINC00958過表達組中上調。在sh-LINC00958腫瘤組織中檢測到HDGF,SERBP1和Ki67表達水平下調,在LINC00958組中上調。
7. m6A修飾與HCC細胞的LINC00958上調相關
HCC細胞的LINC00958中m6A高度富集,HCC組織METTL3表達水平與LINC00958的水平正相關。在METTL3沉默的HCC細胞中LINC00958的m6A水平較低,METTL3下調與LINC00958表達水平降低有關actinomycin D處理HCC細胞可阻止轉錄,發現發現METTL3的沉默降低LINC00958在細胞中的半衰期。這些表明METTL3介導m6A與LINC00958的上調有關,可能是通過調節其轉錄本的穩定性來實現的。DNA甲基化和組蛋白修飾不影響肝癌中的LINC00958。
8. PLGA-PEG(si-LINC00958) NPs在HCC PDX模型中的表征及治療效果
研究LINC00958作為HCC治療劑的潛在用途,開發基于PLGA的新型納米平臺封裝si-LINC00958,稱為PLGA-PEG(si-LINC00958)NP。PLGAPEG(si-LINC00958)NP呈球形,并尺寸分布窄,平均直徑為170.49±4.45 nm。Courmarin-6標記的NP與細胞孵育,顯示強熒光信號,表明NP增加了細胞對藥物的吸收。小鼠通過尾靜脈注射PLGA-PEG(si-LINC00958)NP,腫瘤生長受到明顯抑制。異種移植鼠敲低LINC00958,SREBP1和HDGF的表達水平下調。生存分析表明PLGA-PEG(si-LINC00958)NP的全身給藥延長了小鼠的總生存期。評估PLGA-PEG(si-LINC00958)NP的全身毒性,靜脈注射PLGAPEG(si-LINC00958)NPs后小鼠主要器官包括肝,腎,肺,脾,和心臟無明顯毒性,沒有明顯的肝毒性和腎毒性。