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原來lncRNA阻礙侵襲也不一定是好事!

欄目:最新研究動態 發布時間:2020-05-08
Pumilio(PUM)蛋白是高度保守的RNA結合蛋白家族的成員,該家族在轉錄后調節許多生物體中的基因表達......

   Pumilio(PUM)蛋白是高度保守的RNA結合蛋白家族的成員,該家族在轉錄后調節許多生物體中的基因表達。但是,它們在胎盤中的作用尚不清楚。胚胎著床時,滋養細胞粘附在母體子宮內膜上,然后侵入母體子宮內膜,最終形成胎盤。目前,在人類胎盤發育過程中發現了兩種主要的滋養細胞譜系:絨毛滋養細胞和外滲滋養細胞(EVTs)。EVT的侵襲是胚胎植入和胎盤形成的重要過程。EVT侵襲不充分和子宮螺旋動脈重構受損是子癇前期(PE)發生的啟動因素。本文確定了一種新的RNA調控機制,揭示了在PE發病機理中,調控PUM1 / HOTAIR在滋養細胞入侵中調控的新途徑,并于今年12月發表在Molecular Therapy (IF: 8.402)。
主要結果如下:

1、PE患者滋養細胞中PUM1表達水平升高
   收集妊娠中期絨毛組織,探討PUM1和PUM2在PE發病中的作用,PUM1在PE中的mRNA和蛋白水平均上調(Fig 1A-B)。此外,與HC組相比,早發型PE組和晚發型PE組的絨毛組織中PUM1陽性信號更強(Fig 1C-F)。總之,PUM1在PE患者滋養細胞中高表達。

                                                           圖1 PE患者滋養細胞中PUM1表達水平升高

2、PUM1抑制HTR-8細胞的增殖和侵襲
   如圖2所示,與對照組相比,干擾PUM1后HTR-8細胞的增殖和侵襲能力顯著升高,表明PUM1抑制HTR-8細胞的增殖和侵襲。

                                                                 圖2 PUM1抑制HTR-8細胞的增殖和侵襲

3、在絨毛外滋養細胞外植體培養模型中PUM1弱化了EVTs的入侵和遷移能力
   為進一步研究PUM1在滋養細胞侵襲中的作用,從新鮮妊娠早期胎盤組織中分離出細胞滋養細胞(CT)和侵襲性滋養細胞(EVT)。采用qRT-PCR檢測妊娠早期胎盤絨毛組織及CT、EVT細胞的PUM1 mRNA表達水平,結果發現,EVT細胞中PUM1 mRNA的表達水平低于CT細胞,表明PUM1可能在體內調控EVT的侵襲中發揮重要作用。
   然后研究PUM1是否對滋養細胞的體外遷移能力有影響。從妊娠前3個月(妊娠6-10周)的胎盤中取出胎盤絨毛,分成兩組,在涂有基質的培養皿中培養。培養24h后,siCtrl和siPUM1組之間沒有觀察到顯著差異。體外培養72h后,siPUM1處理的外植體比siCtrl處理的外植體遷移得更遠(圖3A和3B)。全量免疫熒光染色顯示了胎盤絨毛中PUM1的沉默效率(圖3C和3D)。
   為了進一步闡明PUM1對滋養層細胞入侵的調控,從健康的絨毛中獲得新鮮外植體,并將其分為兩組。結果表明,lenti-PUM1處理的外植體的遷移能力低于lenti-ctrl處理的外植體(圖3E和3F)。綜上,PUM1抑制EVT入侵并支持PUM1可能是PE的關鍵介體的觀點。

                                                               圖3 PUM1減少了外植體中滋養層的生長

4、HOTAIR是PUM1在滋養層中的一個下游基因
   為了闡明PUM1在PE發病機制中調控滋養細胞侵襲的分子機制,將HTR-8細胞轉染siCtrl或siPUM1后培養48h的細胞進行lncRNA測序,得到178個差異表達lncRNA,與對照相比,siPUM1中101個上調77個下調(圖4A);其中22個lncRNA的表達水平發生了顯著變化 (圖4B),經qRT-PCR驗證,有12個的表達模式一直(圖4C)。用PUM1過表達質粒轉染HTR-8細胞,qRT-PCR結果顯示,lncRNAs HOTAIR、HAGLR和CTD-2228K2.7在PUM1過表達組滋養細胞中表達較低;與此相反,MEG3、SNHG1、SNHG6和linc01085在PUM1過表達的滋養細胞中顯著升高(圖4D)。之后,使用RIP實驗,結果發現只有HOTAIR顯著富集(圖4E)。此外,敲低PUM1可顯著促進HOTAIR在HTR-8細胞中的表達,而過表達PUM1可降低HOTAIR的表達(圖4F和4G)??傊琍UM1在胞質內與HOTAIR特異性相互作用,調節HOTAIR的表達。

                                                              圖4 PUM1下調滋養細胞中HOTAIR的表達

5、PUM1在滋養細胞中調節HOTAIR的表達和穩定性
   為了進一步闡明PUM1調節滋養細胞中HOTAIR表達的潛在分子機制,根據UGUARAUA共有序列,在HOTAIR的第六個外顯子區域(0.5 2.3 kb)中預測了四個PUM1結合位點,這些PUM1結合位點稱為A,B,C和D(圖5A)。熒光素酶結果顯示,在對照組和PUM1沉默下,HTR-8細胞中MUT C的熒光素酶活性,特別是MUT D報告質粒的熒光素酶活性顯著增加(圖5B和5C),表明HOTAIR第六外顯子區域中的位點C和D是PUM1的潛在結合位點。RIP結果顯示,與IgG組相比,HOTAIR的C和D位點顯著降低了抗PUM1組的HOTAIR富集(圖5D),這些表明,HOTAIR的C和D位是結合PUM1蛋白的主要位點。RNA親和純化實驗證實PUM1與HOTAIR特異性相互作用(圖5E)。此外,轉染siPUM1后,HOTAIR的半衰期較長,但當用過表達PUM1的質粒轉染細胞時,HOTAIR的半衰期較短(圖5F和5G),揭示了PUM1對HOTAIR RNA穩定性的強烈影響。綜上,PUM1在轉錄后調控HOTAIR。

                                                          圖5 PUM1是HOTAIR滋養細胞中重要的RNA結合蛋白

6、HOTAIR在PE中下調表達并與PUM1表達呈負相關
   作者此前發現,HOTAIR通過激活PI3K- AKT信號通路來促進滋養細胞侵襲。實驗發現,PUM1敲低或HOTAIR過表達增強了Ser473的AKT磷酸化,而PUM1過表達或HOTAIR敲低大大降低了AKT的磷酸化。此外,用HOTAIR過表達加PUM1過表達處理HTR-8細胞可以逆轉PUM1過表達對AKT磷酸化的影響。相反,用HOTAIR siRNA加PUM1 siRNA處理HTR-8細胞也明顯逆轉了HOTAIR敲低對AKT磷酸化的作用(圖6A和6B)。
   此外,與對照組相比,過表達PUM1的HTR-8細胞和原代滋養細胞中侵襲細胞的數量明顯減少,而HOTAIR的過表達逆轉了由PUM1過表達引起的對滋養細胞入侵的影響(圖6C-6F)。進一步驗證PE患者和HCs中滋養細胞中HOTAIR和PUM1 mRNA的表達水平,和預期一致,與HC組相比,PE組的滋養細胞中PUM1 mRNA的水平明顯較高,而HOTAIR的水平顯著較低(圖6G和6H)。線性相關分析表明,絨毛組織中HOTAIR水平與PUM1 mRNA水平呈負相關(圖6I)。綜上所述,PUM1 / HOTAIR / p-AKT途徑在調節滋養細胞入侵中具有重要的功能。

                                                       圖6 PUM1/HOTAIR/AKT通路參與調節滋養細胞的侵襲
   總之,本文表明PUM1是HOTAIR表達和滋養細胞功能的關鍵調控因子。首先,在PE中,PUM1上調,HOTAIR下調。其次,HOTAIR是滋養層遷移和入侵的有效調節因子,而在PE患者中,該過程不受控制。最后,AKT磷酸化的下調伴隨著PUM1過表達后遷移和侵襲的減少。