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CircFOXO3促進膠質母細胞瘤的進展

欄目:最新研究動態 發布時間:2019-12-05
環狀RNA是一種新發現的內源性非編碼RNA,被認為可以介導多種類型腫瘤的進展......

   環狀RNA是一種新發現的內源性非編碼RNA,被認為可以介導多種類型腫瘤的進展。越來越多的證據表明環狀RNA在癌癥中異常表達,并參與腫瘤的發展,包括增殖、存活和運動。另外環狀RNA主要作為miRNA海綿,它們通過競爭性結合miRNA反應元件相互溝通和調節,進一步調節miRNA靶向基因表達,結合蛋白質,編碼蛋白質和促進核易位。這些發現表明,異位表達的環狀RNA在腫瘤發生和癌癥進展中起重要作用。雖然已經對環狀RNA在GBM中的作用進行了初步研究,但對環狀rna在GBM中的臨床意義和作用機制仍未明確。因此,小編通過以下這篇文章,讓大家對circFOXO3在膠質母細胞瘤中的作用機制有深刻的了解。

   本研究中,首先,我們通過qRT-PCR分析了GBM和非癌組織中circFOXO3的變化。接下來,我們使用功能損失和功能獲得的方法來評估circFOXO3對GBM細胞增殖和侵襲的影響。最后,我們進行了熒光原位雜交、RNA下拉、雙熒光素酶報告基因和RNA免疫沉淀分析,以確認環狀FOXO3和miR-138-5p/miR-432-5p在GBM中的相互作用。并用動物模型驗證了體外實驗結果。
結果:
1.人GBM組織中CircFOXO3高表達
   CircFOXO3包含一個外顯子,該外顯子通過反向剪接最終產生一個1435個核苷酸的轉錄本(圖1A,B)。使用擴增引物在GBM細胞中擴增出連接位點上游和下游約100 bp的CircFOXO3 cDNA,并通過Sanger測序進行分析。結果證實了circFOXO3連接(圖1C)。擴增引物在有或無RNase R處理的cDNA中檢測到環狀RNA,證明circRNA是真正的環狀(圖1D)。
   為了研究circFOXO3在GBM中的表達是否變化,我們檢測了48例膠質瘤和10例正常對照組中circFOXO3的表達。如圖1E所示,高級別膠質瘤(HGG)的circFOXO3明顯高于低級別膠質瘤(LGG)。總之,這些數據表明,circFOXO3表達的增加可能與GBM進展密切相關。接著我們測定了4個GBM細胞(U87-MG、U251-MG、A172和T98G)和人類正常膠質細胞(HEBs)中circFOXO3的表達水平。與HEBs相比,GBM細胞中circFOXO3明顯上調,U251-MG和U87-MG高表達,A172和T98G低表達。因此,U251-MG和U87-MG用于circFOXO3 KD,A172和T98G用于circFOXO3 OE(圖1F)。另外,我們有效地敲除了U87-MG和U251-MG細胞中的circFOXO3(圖1G和1I)。我們還成功構建了circFOXO3表達慢病毒和過表達circFOXO3在A172和T98G中的表達(圖1H,I)。這為接下來探索circFOXO3在GBM細胞中的作用奠定了基礎。

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2.CircFOXO3在體外促進GBM的發生和侵襲
   為了驗證circFOXO3的功能,我們進行了細胞實驗。CCK-8實驗表明,circFOXO3 KD可以顯著抑制U87-MG和U251-MG細胞的增殖(圖2A,B)。此外,集落形成實驗表明,circFOXO3 KD可以減少集落數量(圖2C,E)和體積(圖2F)。然后,我們使用transwell和傷口愈合試驗來分析circFOXO3對GBM細胞侵襲的影響。Transwell實驗表明,circFOXO3 KD細胞的侵襲力明顯減弱(圖2 G-I)。此外,傷口愈合實驗表明,U87-MG和U251-MG的傷口閉合速度比對照組慢(圖2J-L)。總的來說,這些發現為circFOXO3 KD在體外抑制GBM細胞的增殖和侵襲提供了證據,circFOXO3水平的升高對促進GBM細胞的腫瘤發生和侵襲具有重要作用。

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3.CircFOXO3GBM細胞中充當MiR-138-5pMiR-432-5p的海綿
   環狀RNA主要位于細胞質中,通常作為miRNA海綿來調控表達和活性。因此,我們首先搜索了circRNADb數據庫,發現circFOXO3沒有預測到任何蛋白特征。第二,FISH分析顯示circFOXO3含量豐富,位于胞質中(圖3A)。基于上述發現,我們探討了circFOXO3是否與miRNAs結合。
   我們在不同的公共數據庫(RegRNAstarBasemiRDBCircInteractome)和以前的報告中篩選并分析了2miRNA miR-138-5pmiR-432-5p)。這些miRNA在膠質瘤中表達下調,且與circFOXO3相關的特異性miRNA有多個結合位點。在尋找與circFOXO3結合的miRNAs時,我們發現在circFOXO3miR-138-5p/miR- 432-5p的結合位點(圖3B)。隨后,我們研究了circFOXO3GBM細胞中miR-138-5p/ miR-432-5p的相關性。MiR-138-5pmiR-432-5p表達在circFOXO3 KD后上調,在circFOXO3 OE后下調(圖3CD)。此外,過表達miR-138-5p/miR-432-5p后,circFOXO3水平明顯降低,抑制miR-138-5p/miR-432-5p后,circFOXO3水平升高(圖3EF)。
   為了驗證circFOXO3miR-138-5p/miR-432-5p之間的直接結合,我們進行了生物素偶聯miRNA捕獲和熒光素酶活性測定。生物素標記的miR-138-5p/miR-432-5p及其突變模擬物被設計用于拉低過表達circFOXO3T98G細胞中的circFOXO3。與突變體相比,我們發現野生型miR-138-5p/miR-432-5pcircFOXO3明顯富集(圖3G)。此外,HEK293T細胞共轉染miR-138-5p/miR-432-5p模擬物和熒光素酶報告基因。與對照組相比,miR- 138-5p/miR-432-5p轉染降低了熒光素酶報告基因的活性。然后,我們對miR-138-5p/miR-432-5p的預測結合位點進行突變,發現miR-138-5p/miR-432-5p模擬物和對照組的熒光素酶報告基因活性沒有差異(圖3H)。先前研究表明,環狀RNAmiRNA的結合是由AGO2介導的。因此,我們在U87-MG中進行了anti-AGO2 RIP實驗,結果顯示circFOXO3miR-138-5p/miR-432-5pAGO2中富集(圖3I)。這些結果表明circFOXO3可以作為miR-138-5p/miR-432-5p的海綿。


4.MiR-138-5p/miR-432-5p通過靶向GBM細胞中的NFAT5而下調并作為抑癌基因
   考慮到circFOXO3miR-138-5p/miR-432-5p之間的相互作用,我們接下來評估了miR-138-5p/miR-432-5pGBM中的表達和功能。如圖4AB所示,HGGmiR-138-5p/miR-432-5p明顯低于正常對照組。此外,CCK-8實驗顯示,miR-138-5p/miR-432-5p表達降低可顯著提高細胞活力(圖4CD)。此外,transwell實驗表明,miR-138-5p/miR-432-5p抑制劑轉染細胞的侵襲能力明顯高于nc轉染細胞(圖4E)。
   根據既往報道,某些GBM致癌基因是miR-138-5p/miR-432-5p的靶標。因此,使用mirDIP數據庫在miR-138-5p/miR-432-5p靶標中選擇了14個致癌基因。在這些致癌基因中,有3個(CDK6NFAT5SP1)與腫瘤的進展密切相關。因此,我們改變了miR-138-5p/ miR-432-5p的表達,并檢測了各自靶細胞的水平(圖4FG)。Western blot分析顯示過表達miR-138-5pmiR-432-5p的細胞中NFAT5表達下調,而轉染miR-138-5pmiR-432-5p抑制劑的細胞中NFAT5表達上調(圖4 G)。此外,GBMNFAT5 mRNA和蛋白水平較高(圖4HI)。NFAT5被證明具有miR-138-5p/miR-432-5p的結合位點(圖4J)。然后,克隆NFAT5的野生型和突變體3個未翻譯區域序列,分別構建報告質粒和突變體載體。共轉染miR-138-5p/miR-432-5p模擬物和報告質粒后,熒光素酶活性顯著降低。相反,miR-138-5p/miR- 432-5p模擬物和突變載體共轉染對熒光素酶活性沒有明顯影響(圖4K)。因此,本研究結果證實NFAT5miR-138-5p/ miR-432-5p的直接靶點。

說明: D:\Documents\QQEIM Files\2853119522\FileRecv\MobileFile\Image\SS~6SV)$1M@@SIE_H_0JCKA.png


5.CircFOXO3可以調節MiR-138-5pMiR- 432-5p靶點
   我們測量了這些靶點在circFOXO3 OEKD后的表達。結果表明,當circFOXO3過表達時,NFAT5的上調最為顯著(圖5AB)。鑒于NFAT5circFOXO3共享MREs,我們通過相關性分析和拯救實驗實驗,探討circFOXO3是否通過海綿miR-138-5p/ miR-432-5p調控NFAT5表達,從而發揮其致癌作用。相關分析顯示,circFOXO3NFAT5呈中度正相關(圖5C)。此外,circFOXO3miR-138-5pmiR-432-5p呈中度負相關(圖5DE)。
此外,通過共轉染circFOXO3 KDmiR-138-5p/miR-432-5p抑制劑U87-MG來進行拯救實驗。qRT-PCRwestern blot檢測顯示,與circFOXO3 KD組相比,NFAT5 mRNA和蛋白水平在circFOXO3 KDmiR-138-5p/miR- 432-5p抑制劑共轉染的U87-MG細胞中部分升高(圖5FG)。與circFOXO3 KD組相比,miR- 138-5p/miR-432-5p抑制劑共轉染的U87-MG細胞的增殖能力增強(圖5H)。這些結果表明,抑制miR-138-5p/miR-432-5p可以部分恢復circFOXO3 KD誘導的增殖抑制。同樣,circFOXO3 KD也可以部分減弱miR-138-5p/miR-432-5p介導的U87-MG細胞的侵襲的下調(圖5I)。

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6.CircFOXO3的抑制抑制了異種移植體在體內的生長
   為了確定circFOXO3在體內對GBM進展的影響,我們將circFOXO3 KDcircFOXO3 NC細胞注入麻醉裸小鼠體紋狀體。植入后,少數動物開始出現發病跡象,通過MRI對小鼠進行評估以確定顱內腫瘤形成。結果表明,CircFOXO3抑制顯著降低了腫瘤的生長和侵襲。引人注目的是,植入circFOXO3 KD細胞的小鼠中位生存期為56.5天,而對照組100%37天內死亡(圖6A-D)。在circFOXO3 KD組中,NFAT5的表達持續下降(圖6EF)。總之,這些結果表明,circFOXO3在體內對GBM的進展至關重要。

說明: D:\Documents\QQEIM Files\2853119522\FileRecv\MobileFile\Image\9G~4KYUL@ZF`S6M2NPA6}DU.png


總結:

   我們首次證明circFOXO3GBM組織中過表達,并作為miR- 138-5p/miR-432-5p海綿通過ceRNA機制調節NFAT5的表達,從而在體內外促進腫瘤的發生。我們證明circFOXO3GBM中一個新潛在的治療靶點。我們的發現強調了circRNAmiRNA相互作用在腫瘤發生中的重要性。