目的:利用piRNA測序篩選新型乳腺癌預后生物標記物
Piwi-interacting RNAs (piRNAs)是一類 26 到 32 nt 的非編碼小RNA,在維持生殖細胞系上發揮重要作用,目前還認為其在體細胞中對基因表達起到轉錄后調控的作用。Piwi蛋白是piRNA生物合成和作用途徑的中心,對基因的表達起表觀調控作用。piRNAs/PIWIs已被報道可作為多種癌癥的潛在生物標記物,但其在乳腺癌中的作用尚未得到全面的研究。
研究者分別對來自104個病人的石蠟包埋乳腺腫瘤組織和11個凍存正常乳腺組織進行小RNA測序。結果正常組織獲得10M reads數,腫瘤組織獲得165M reads數,piRNA序列總數4,207,022條,被注釋到676個piRNA上。發現25個差異表達的piRNA,包括17個上調和8個下調piNRA。
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