CircSC使用由171項公共研究中的254590個細胞組成的全長單細胞RNA測序數據集,以生成人類和小鼠細胞中circRNA的綜合表達譜。CircSC在這些scRNA-seq文庫中總共識別了196491個人類和310969個小鼠的circRNAs,揭示了腦樣本、發育中的胚胎和乳腺腫瘤中circRNAs的細胞類型特異性表達模式。
http://159.226.67.237/zhao/Database/circSC/index.html
l Browse
用戶可以獲得每個研究的詳細信息,其中包括count矩陣、circRNA列表和實驗元數據。
點擊“Study”跳轉至詳情頁查看、下載相關信息。對于有足夠細胞進行細胞聚類分析的研究,提供每個細胞簇的標記基因,并根據原始研究中提供的元數據注釋細胞類型。對于少于100個細胞的研究,只提供了circRNA列表。
l Search
用戶可以通過組織、細胞類型、GEO ID和基因組坐標、circRNA ID進行搜索。
點擊“circRNA ID”可跳轉至circAtlas 2.0數據庫查看circRNA相關信息: