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LiqBioer:人工管理的體液中癌癥生物標志物數(shù)據(jù)庫

欄目:最新研究動態(tài) 發(fā)布時間:2022-10-25
研究人員開發(fā)了LiqBioer,其中包含來自 3447 項研究的 6231 條人工整理記錄,涵蓋 22 個組織中的 3056 種生物標志物和 74 種癌癥......


癌癥生物標志物是可測量的指標,在臨床應用中起著至關(guān)重要的作用。自液體活檢發(fā)展以來,體液中的生物標志物引起了相當大的關(guān)注,其數(shù)據(jù)量也在迅速增加。 然而,盡管有少量小規(guī)模和特定的數(shù)據(jù)資源,但目前的研究缺乏將已發(fā)表的癌癥體液生物標志物匯編成一個集中且可持續(xù)的研究人員和臨床醫(yī)生存儲庫。 為了實現(xiàn)這一目的,研究人員開發(fā)了LiqBioer,其中包含來自 3447 項研究的 6231 條人工整理記錄,涵蓋 22 個組織中的 3056 種生物標志物和 74 種癌癥。

LiqBioer 允許用戶瀏覽和下載有關(guān)體液生物標志物的綜合信息,包括癌癥類型、來源研究和臨床使用。

http://www.medsysbio.org:8080/LiqBioer/



l  Quick Search

在Home頁提供快速查詢功能。用戶輸入感興趣的標志物(基因名、細胞、)或疾病名稱,單擊回車鍵進行查詢即可。以TP53為例:



結(jié)果頁面中除顯示疾病、相關(guān)藥物等信息,還可以點擊“PMID”查看相關(guān)文獻支持:



l  Browser

該模塊允許用戶通過點擊卡片來瀏覽生物標志物的不同方面,包括標志物、癌癥類型、藥物信息、標志物得分、其他物種相關(guān)信息。



以“Cancer Types”為例,單擊該卡片跳轉(zhuǎn)至以下頁面,選擇相應的部位,如“Brain”:



頁面跳轉(zhuǎn)至腦部相關(guān)的標志物詳情頁,點擊“PMID”可以查看相關(guān)文獻支持:




l  Search

與“Quick Search”相比,該模塊支持更詳細的搜索條件。用戶可以在A區(qū)中選擇物種、體液類型、臨床用法及標志物類型,然后在B區(qū)中輸入標志物名稱或者癌癥類型,點擊“search”進行搜索:



結(jié)果如下所示:



l  Download

點擊“Format”選項,根據(jù)需求選擇下載txt或者xlsx格式即可: