韩国漂亮老师做爰bd_欧洲欧美成人免费大片_美女的屁股视频网站_徐若瑄三级真做

LncPep:lncRNA編碼肽段數據庫

欄目:最新研究動態 發布時間:2022-05-27
LncPep共涵蓋 39 個不同物種的883,804個lncRNA 翻譯的10,580,228個肽段。肽段預測應用了質譜、核糖體分析......


長鏈非編碼 RNA (lncRNA) 是一種大于 200 個核苷酸的轉錄物,已被證明在多個物種中發揮強大的調節功能,通常缺乏編碼蛋白質的能力。然而,越來越多的證據表明 lncRNA 能夠編碼在生物過程和疾病中發揮相關活性的肽。

LncPep (http://www.shenglilabs.com/LncPep/)共涵蓋 39 個不同物種的883,804個lncRNA 翻譯的10,580,228個肽段。肽段預測應用了質譜、核糖體分析、Pfam、翻譯起始位點、RNA 位點的 N6-甲基腺苷修飾、CPC2 和 CPAT 的方法。

                                               


l  Browse



選擇感興趣的物種,如“Human”,選擇編碼肽預測方式,點擊”Sort“后,將在下方顯示該物種特定預測方式下所有編碼肽段的lncRNA。

點擊結果中藍色的信息,可以獲得lncRNA/肽的詳細信息。


l  Validated



該模塊展示了有文獻支持的編碼肽的lncRNA,點擊PMID可以跳轉到文獻。

l  Search



該模塊提供了4種搜索方式:通過lncRNA/宿主基因/染色體位置/編碼預測方式進行搜索。



l  Predict


輸入1000bp以內的fasta格式lncRNA序列,選擇相應物種,點擊“Predict“,將在下方顯示預測結果:



l  Blast


輸入1000bp以內的fasta格式lncRNA序列或者肽,選擇相應物種,點擊“Blast“,將在下方顯示預測結果,點擊”link“查看詳細信息: