蛋白質的電荷是其關鍵的物理化學特性之一，并且與pKa解離常數有關（pKa是溶液中酸強度的定量度量）。對于蛋白質和多肽，應考慮七種帶電氨基酸的可電離基團：谷氨酸（γ-羧基）、半胱氨酸（硫醇基）、天冬氨酸（β-羧基）、酪氨酸（酚基）、賴氨酸（ε-銨組）、組氨酸（咪唑側鏈）和精氨酸（胍基團）。總之，所有帶電基團的pKa值可用于計算分子在任何 pH 值下的總電荷或估計等電點 ( pI, IEP)，即正負電荷平衡的pH值，因此分子的總凈電荷等于零。pKa和等電點估計均已用于多種技術，例如二維凝膠電泳 (2D-PAGE)、結晶、毛細管等電聚焦和質譜 (MS )。但當前蛋白質等電點數據庫仍非常有限。

近期，波蘭研究團隊建了一個蛋白質等電點數據庫：Proteome-pI 2.0（http://isoelectricpointdb2.org），該數據庫相關文章刊登在Nucleic Acids Research期刊（IF=16.971），題名為Proteome-pI 2.0: proteome isoelectric point database update。該數據庫囊括了來自20115個蛋白質組的單個蛋白質的等電點，21種算法預測等電點，包括超過6100萬種蛋白質的pKa解離常數的預測。

    該數據庫支持自主瀏覽和搜索。

      ProteomepI 2.0 提供了與分子量分布和跨界等電點或氨基和二氨基酸統計相關的全局分析。此類數據可用于特定分類單元的高通量分析，例如植物真菌或相互作用的蛋白質組。