導語:哮喘是兒童和成人最常見的慢性呼吸道疾病之一,其重要分子機制是炎癥。巨噬細胞是肺內最豐富的免疫細胞,在以2型反應為主的過敏性哮喘中起重要作用。長鏈非編碼RNAs(lncRNAs)的失調與多種人類疾病有關,在免疫系統的基因調控中發揮重要作用。非編碼RNA與巨噬細胞活化的研究思路值得探索。
參考文獻:Xia L , Wang X , Liu L , et al. Lnc-BAZ2B promotes M2 macrophage activation and inflammation in asthmatic children through stabilizing BAZ2B pre-mRNA[J]. Journal of Allergy and Clinical Immunology, 2020. (IF: 10.228)
技術路線:
結果:
1. lnc-BAZ2B在哮喘兒童中上調
為鑒定哮喘兒童中差異表達的lncRNA,通過轉錄組芯片分析哮喘兒童和健康對照PBMCs中lncRNA和mRNA表達譜。發現719個lncRNA基因在哮喘患兒中存在差異表達,34個上調的非外顯子正義lncRNA具有基因符號描述,選擇5個使用RT-qPCR在另外50例哮喘患者和46例健康對照的PBMC樣本數量中驗證。分析哮喘患者PBMCs中mRNA表達譜,發現382個mRNA在哮喘患者中存在差異表達,基因本體富集分析發現2型免疫反應和2型免疫反應調節類別富集,表明2型免疫反應在過敏性哮喘中起重要作用。
評估PBMCs中T細胞、B細胞和單核細胞中LncRNA的表達,發現LOC643072主要在單核細胞中表達。LOC643072的表達在IL-4誘導的m2巨噬細胞活化過程中增強,在LPS誘導的M1巨噬細胞活化過程中下降。表明LOC643072可能在巨噬細胞活化中發揮重要作用。lncRNA LOC643072的序列定位在其順式基因的反鏈上,與鋅指結構域2B(BAZ2B)相鄰的溴結構域,因此被命名為lnc-BAZ2B。
2. Lnc-BAZ2B促進M2巨噬細胞活化
為確定Lnc-BAZ2B是否調節巨噬細胞活化,評估了IL-4刺激后Lnc-BAZ2B功能喪失和獲得對THP1來源的人巨噬細胞活化的影響。發現巨噬細胞中lnc-BAZ2B敲除顯著損害了M2特異性標記基因的表達,包括CLEC7A、IL1RA、CCL18和IRF4。相反,巨噬細胞過表達lnc-BAZ2B時,M2特異性標記基因的表達水平顯著增加。提示lnc-BAZ2B促進M2巨噬細胞活化。STAT6是IL-4信號通路中的主要轉錄因子, IL-4刺激STAT6敲除的M2巨噬細胞中lnc-BAZ2B的表達水平急劇下降。綜上所述,提示IL-4通過STAT6活化誘導lnc-BAZ2B表達,然后促進M2巨噬細胞活化。
3. Lnc-BAZ2B通過增強BAZ2B表達促進M2巨噬細胞活化
研究lnc-BAZ2B對M2巨噬細胞活化的影響是否是由于其對BAZ2B表達的影響。lnc-BAZ2B敲除導致THP1來源的巨噬細胞中BAZ2B表達減少,而lnc-BAZ2B的過表達顯著增加BAZ2B mRNA的水平。這些發現證實了lnc-BAZ2B可以正調控BAZ2B表達。IL-4刺激BAZ2B敲除的M2巨噬細胞表現出M2相關基因的表達顯著降低。當BAZ2B被敲除時,lnc-BAZ2B的表達沒有差異,表明lnc-BAZ2B是BAZ2B的上游調節因子。
當lnc-BAZ2B或BAZ2B/ Baz2b下調時,編碼控制M2巨噬細胞活化的關鍵轉錄因子IRF4的表達水平顯著降低,IRF4和M2巨噬細胞標記基因的水平隨著lnc-BAZ2B的過表達而上調。在過表達lnc-BAZ2B的巨噬細胞中敲低IRF4的表達,觀察到M2巨噬細胞相關基因的表達被逆轉。這表明lnc-BAZ2B和BAZ2B主要通過上調IRF4促進M2巨噬細胞活化。由于BAZ2B是H3K14ac閱讀器,使用抗H3K14ac抗體進行了ChIP實驗,發現H3K14ac確實在IRF4啟動子處富集。提示BAZ2B作為H3K14ac閱讀器,主要通過上調IRF4的轉錄促進M2巨噬細胞活化。
4. Lnc-BAZ2B通過穩定pre-mRNA增強BAZ2B的表達
lnc-BAZ2B以35%:65%的比例在細胞核和細胞質中表達。
lncBAZ2B序列定位于其順式基因BAZ2B的反鏈,lnc-BAZ2B的59末端與BAZ2B pre-mRNA的59末端互補。lnc-BAZ2B敲低后,BAZ2B前RNA和成熟mRNA的表達水平均顯著降低,過表達lnc-BAZ2B的巨噬細胞中,BAZ2B和BAZ2B pre-mRNA的表達均上調。RNase保護試驗發現當使用位于lnc-BAZ2B和BAZ2B互補區域的引物時,RNase A1T消化后仍可通過PCR擴增BAZ2B pre-mRNA。這些結果表明,lnc-BAZ2B和BAZ2B的pre-mRNA可能形成雙鏈體,保護BAZ2B premRNA不被RNA酶降解。放線菌素D(轉錄抑制劑)處理巨噬細胞,發現隨著lnc-BAZ2B的過表達,放線菌素D處理后巨噬細胞中BAZ2的降解慢。說明lnc-BAZ2B在轉錄后水平調控BAZ2B表達。提示lnc-BAZ2B和BAZ2B的pre-mRNA可以形成雙鏈體,增加BAZ2B pre-mRNA的穩定性,進一步增加BAZ2B成熟mRNA的水平。
5. Lnc-BAZ2B和BAZ2B加劇CRE-誘導的肺部炎癥
在CRE-誘導肺部炎癥小鼠中出現哮喘病理學,炎癥細胞顯著募集至肺部,致密的支氣管周圍浸潤和杯狀細胞增生,CRE-處理小鼠中lnc-BAZ2B過表達顯著增強肺部炎癥,CRE處理的Baz2b敲低小鼠顯示肺部炎癥減少,浸潤的炎性細胞減少,Muc5ac表達水平降低。
肺部炎癥,比較不同組小鼠肺組織中小鼠M2巨噬細胞特異性標志基因的表達水平。發現CRE-處理小鼠中M2特異性標記基因的表達水平,包括Mrc1、Arg1、Clec7a和Irf4,增加,Baz2b mRNA表達高于PBS激發小鼠。這些結果表明lnc-BAZ2B和BAZ2B可以通過促進M2巨噬細胞活化加劇變應原誘導的肺部炎癥。
6. 哮喘患兒PBMCs中Lnc-BAZ2B表達與BAZ2B表達相關
進一步驗證lnc-BAZ2B和BAZ2B是否通過促進體內M2巨噬細胞活化加劇CRE-誘導的哮喘。測定過敏性哮喘兒童和健康對照受試者PBMCs中Lnc-BAZ2B和BAZ2B的表達水平,發現哮喘兒童中lnc-BAZ2B的表達水平顯著高于健康兒童。在哮喘兒童中檢測到lnc-BAZ2B和BAZ2B之間呈正相關。lnc-BAZ2B表達較高的哮喘患者的血嗜酸性粒細胞計數和百分比高于lnc-BAZ2B表達水平較低的患者。這些發現暗示lnc-BAZ2B有可能作為兒童哮喘的生物標志物。
總結:1.首次證明lnc-BAZ2B通過促進M2巨噬細胞活化增強過敏性哮喘的疾病嚴重程度。
2. Lnc-BAZ2B通過雙鏈體形成增強BAZ2B pre-mRNA的穩定性,BAZ2B增加M2巨噬細胞標記基因的轉錄。
3. lnc-BAZ2B和BAZ2B在過敏性哮喘進展中至關重要,可作為兒童哮喘的潛在治療和診斷靶點。