導語:有氧糖酵解,也稱為Warburg效應,是正常細胞和惡性腫瘤細胞之間最顯著的差異。腫瘤細胞主要利用糖酵解途徑提供能量,提高逃避凋亡、侵襲和抵抗化療藥物的能力。代謝異常是惡性腫瘤的標志之一。環狀RNA(circRNA)是一類內源性非編碼RNA,在轉錄或轉錄后水平調控基因,執行多種生物學功能。circRNA是否參與腫瘤的代謝轉化?
參考文獻:Shen, S., et al., CircECE1 activates energy metabolism in osteosarcoma by stabilizing c-Myc. Molecular cancer, 2020. 19(1): p. 151. (IF= 15.302)
技術路線:
結果:
1. CircECE1在骨肉瘤(OS)組織和細胞系中過表達
RNA免疫沉淀用于檢測OS細胞系中與c-Myc結合的circRNA,發現hsa_circ_0002402(CircECE1)富集最為顯著。CircECE1在OS組織中的表達高于軟骨瘤組織,肺轉移瘤中CircECE1的表達高于原發性OS組織。CircECE1在OS細胞系中的表達也高于hFOB1.19細胞系,在U2OS和143B細胞中表達最高。CircECE1由位于1號染色體上的ECE1基因生成,用收斂和發散引物、RNase R處理評估CircECE1的環狀結構。RNA FISH檢測發現CircECE1主要定位于細胞質和細胞核。這些發現揭示了CircECE1在OS組織和細胞系中過表達,并定位于細胞質和細胞核。
2. CircECE1促進OS細胞的遷移和增殖,調控c-Myc功能
使用CCK-8和EDU試驗評估細胞活力,發現CircECE1敲除損害增殖,增強了凋亡率,CircECE1過表達促進增殖,顯著降低OS細胞的遷移能力,可以通過CircECE1過表達來挽救。這些發現表明CircECE1在體外OS細胞的存活和增殖中發揮作用。
為確定CircECE1是否影響C-Myc功能靶基因。在CircECE1過表達和敲除細胞中分析一些已知的c-Myc靶標(JunB、Mdm2、HIF1α、c-Jun、ELK-1和Cdc25a)的表達,發現幾個c-Myc靶標在CircECE1過表達的OS細胞中上調,在CircECE1敲除的OS細胞中下調。c-Myc敲低阻斷了由CircECE1過表達誘導的JunB、Mdm2、HIF1α、c-Jun、ELK-1和Cdc25a的上調。說明CircECE1調控c-Myc功能。
3. CircECE1與c-Myc相互作用,防止其被SPOP降解
HEK-293 T細胞與CircECE1和編碼各種c-Myc蛋白片段的載體共轉染,證明c-Myc片段2與CircECE1相互作用。CircECE1過表達導致細胞中c-Myc蛋白水平增加。蛋白合成抑制劑CHX處理CircECE1-WT/MUT過表達細胞,用蛋白酶體抑制劑硼替佐米處理CircECE1敲低細胞。CHX處理降低細胞中的c-Myc蛋白,CircECE1 WT細胞中c-Myc的半衰期顯著延長。硼替佐米治療逆轉CircECE1敲低誘導的c-Myc蛋白下降。在用NEM(內源性去泛素化酶抑制劑)或PR-619(非選擇性去泛素化酶抑制劑)處理后,c-Myc在CircECE1敲除細胞中泛素化更多,在CircECE1過表達細胞中泛素化更少。這些表明CircECE1轉錄后調節OS細胞中c-Myc水平。
為檢測E3泛素連接酶接頭SPOP是否參與CircECE1介導的c-Myc表達調控,在CircECE1敲除細胞中敲除SPOP。SPOP敲除消除了CircECE1敲除誘導的c-Myc蛋白水平的下降。
RIP實驗顯示CircECE1與c-Myc相互作用,但不與SPOP相互作用,Co-IP實驗發現CircECE1敲低增強了細胞中SPOP和c-Myc之間的相互作用。這些結果表明CircECE1與cMyc相互作用阻止SPOP介導的降解。
4. CircECE1過表達促進Warburg效應
研究CircECE1是否參與糖酵解和能量代謝。CircECE1失調影響參與葡萄糖攝取、糖酵解和乳酸分泌的各種關鍵調節因子的表達水平,而CircECE1敲低具有相反的作用。為滿足快速增殖和轉移的需求,惡性腫瘤細胞依靠葡萄糖代謝產生ATP,CircECE1過表達增加細胞中ATP的產生,增加細胞的線粒體膜電位。在circECE1過表達細胞中,細胞外酸化率(ECAR)和耗氧率(OCR)增加。綜上所述, CircECE1在OS細胞的葡萄糖代謝中起著至關重要的作用。
5. c-Myc介導CircECE1在糖代謝中的功能
c-Myc敲除后,與葡萄糖代謝相關的糖酵解酶的表達不能上調。CircECE1 MUT過表達導致ATP生成減少。與CircECE1 WT相比,CircECE1 MUT也降低了細胞的線粒體膜電位,抑制葡萄糖攝取和乳酸生成。這些結果證實c-Myc介導了CircECE1在葡萄糖代謝中的功能。CircECE1 MUT顯著抑制OS細胞的增殖和集落形成能力,降低遷移能力,增強了細胞凋亡率。這些表明c-Myc介導了CircECE1在葡萄糖代謝中的功能。
6. TXNIP是OS中CircECE1的靶點
為確定CircECE1介導的糖代謝調節的分子機制,RNA-seq鑒定CircECE1過表達改變的信號通路。TXNIP是差異表達基因之一,是一個公認的糖代謝調節因子,在一些癌細胞中受c-Myc的調控。在兩個OS細胞系中,cMyc和CircECE1敲除均顯著改變TXNIP mRNA表達,c-Myc抑制TXNIP啟動子活性,c-Myc敲低增加細胞中TXNIP蛋白水平。這些發現表明c-Myc阻斷TXNIP轉錄。TXNIP可抑制與葡萄糖代謝相關的糖酵解酶的表達,降低細胞的增殖。CircECE1過表達后TXNIP蛋白水平下降,TXNIP可以在體外逆轉CircECE1 WT過表達的影響,包括調節參與葡萄糖攝取、糖酵解、乳酸分泌、ATP產生、葡萄糖攝取、乳酸產生、ECAR、OCR、增殖、遷移和凋亡。TXNIP是CircECE1調節糖代謝的重要下游效應因子。
7. CircECE1在異種移植模型中促進腫瘤生長和轉移,增加葡萄糖利用
裸鼠皮下注射CircECE1 WT-或MUT-過表達的143B細胞。與對照或CircECE1 MUT細胞相比,CircECE1 WT細胞具有更高的腫瘤生長率,糖酵解酶的mRNA和蛋白水平在CircECE1 WT組異種移植瘤的組織中顯著上調。將同時用發光染料和GFP標記的143B細胞注射到尾靜脈接種到肺腔,體內生物發光成像證明CircECE1 WT促進OS細胞原位轉移,而CircECE1 MUT細胞不能形成肺轉移。IHC測量軟骨瘤和OS患者樣本中TXNIP和糖酵解酶的表達,發現OS中TXNIP表達降低,糖酵解酶表達增加。這些表明CircECE1通過阻止OS中SPOP降解c-Myc介導能量代謝。