Kaplan Meier plotter能夠評估54k基因(mRNA,miRNA,蛋白質)對21種癌癥類型(包括乳腺癌(n = 6,234),卵巢癌(n = 2,190),肺癌(n = 3,452)和胃癌)的存活率的影響 (n = 1,440)。Kaplan Meier plotter 數據庫的來源包括GEO,EGA和TCGA。 該工具的主要目的是基于薈萃分析的生存生物標記物的發現和驗證。
現在我們以“LAYN基因與乳腺癌生存率的相關性分析”為例,來演示Prognoscan的使用方法:
1.首先打開Kaplan Meier plotter地址(http://kmplot.com/analysis/)
2.然后輸入LAYN基因,Survival一欄選擇根據條件可以選擇OS、RFS、DMFS或PPS等生存因素
3.點擊draw Kaplan Meier plot生成圖片
4.得到含有HR和logrank P值的結果圖:
今天的分享就到這里啦,希望能幫到苦心科研的你,我們下次再見!