腎細胞癌(RCC)是世界上最致命的惡性腫瘤之一,2020年預計美國有七萬新增病例及一萬四千的死亡病例。circRNA已在多種人類癌癥中表現出關鍵作用,然而其在RCC中的作用仍保有較大程度的未知性。本文發現circPTCH1通過調控miR-485-5p/MMP14軸促進RCC的侵襲和遷移,于2020年10月發表于《Theranostics》IF:8.579。
技術路線如下:
主要結果如下:
1、RCC細胞中circPTCH1的芯片分析與鑒定
作者通過對5種轉移性RCC細胞系和配對的正常切片的芯片分析,鑒定差異表達的circRNA,作者挑選的是最顯著的5個進行qRT-PCR分析,最終確認只有hsa_circ_0139402在RCC細胞系中顯著上調(Figure 1A-B)。其結構組成是來源于宿主基因PTCH1外顯子13和14背向剪切形成,將其命名為circPTCH1。circPTCH1不能被RNase R酶消化,定位于細胞質。
圖1 circPTCH1在RCC細胞中的表達及特征分析
2、circPTCH1增強RCC的遷移和侵襲
如圖2所示,敲除circPTCH1后RCC細胞系的遷移和侵襲減弱,相反,過表達circPTCH1后RCCC細胞系的遷移和侵襲增強。
圖2 circPTCH1在體外可增強RCC細胞的遷移和侵襲能力
3、在RCC細胞中circPTCH1作為miR-485-5p的海綿
眾所周知,定位于細胞質的circRNA通常是作為miRNA的海綿發揮作用,因此本文通過三個數據庫共同鑒定到9個潛在的靶向miRNA(Figure 3A-B)。生物素探針實驗發現只有miR-485-5p, miR-545-3p, 和miR-330-5p可以被顯著下拉富集(Figure 3C-E)。進一步的,只有miR-485-5p在腫瘤中顯著下調,并經實驗證實與circPTCH1存在相互結合作用。這些結果表明,在RCC細胞中circPTCH1作為miR-485-5p的海綿發揮作用。
圖3 circPTCH1作為miR-485-5p的海綿
4、miR-485-5p通過靶向MMP14抑制RCC細胞的遷移和侵襲
如圖4A-D所示,抑制或過表達miR-485-5p會增強或減弱RCC細胞的遷移和侵襲。隨后,通過4個數據庫共同確定了39個潛在的靶基因,其中MP14的表達最為豐富。實驗發現MMP14的表達水平在腫瘤組織中顯著上調,與miR-485-5p的表達負相關,且兩者具有相互結合作用。抑制或過表達miR-485-5p會增強或減弱RCC細胞中MMP14的蛋白表達水平。這些結果表明miR-485-5p通過靶向MMP14抑制RCC細胞的遷移和侵襲。
圖4 miR-485-5p在體外通過靶向MMP14抑制細胞遷移和侵襲
5、circPTCH1通過miR-485-5p/MMP14促進RCC細胞的遷移,侵襲,和EMT
作者隨后通過挽救實驗進一步發現,circPTCH1的干擾降低了RCC細胞的遷移能力,然而,與miR-485-5p抑制劑共轉染可以部分消除這種效應。此外,敲除circPTCH1降低了MMP14的水平,但共轉染miR-485-5p抑制劑可以恢復期表達。類似的現象也在N-candherin和Vimentin中觀察到,而E-candherin表達趨勢則完全相反。這些結果表明circPTCH1通過miR-485-5p/MMP14促進RCC細胞遷移,侵襲,和EMT表型。
圖5 circPTCH1通過miR-485-5p/MMP14軸促進RCC細胞的遷移、侵襲和EMT
與體外實驗結果一致,如圖6所示,過表達circPTCH1小鼠體內的腫瘤轉移結節顯著增多,而抑制miR-485-5p則能部分緩解這種效應,表明circPTCH1在體內通過miR-485-5p/MMP14軸促進腫瘤轉移和RCC進展。
圖6 circPTCH1在體內促進腫瘤轉移
總之,本文發現PTCH1基因13和14號外顯子反向剪切形成的circPTCH1在細胞質中海綿吸附miR-485-5p,而miR-485-5p可以靶向調節MMP14的表達,進而促進EMT表型,最終導致RCC的進展和轉移(圖7)。
圖7 原理圖顯示circPTCH1通過miR-485-5p/MMP14軸促進RCC轉移