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手把手教你使用TCGA下載轉錄組數據

欄目:最新研究動態(tài) 發(fā)布時間:2020-11-06
教你使用TCGA下載轉錄組數據,首先打開瀏覽器搜索“TCGA GDC”....

1.打開瀏覽器搜索“TCGA GDC”

2.鼠標放置在 “Repository”處就會看到出現(xiàn)“browse and download data”字樣,說明轉錄組數據是在這里下載的

3.進入“Repository”后先看右上角“Cart”處是否為“0”,不為零的話要先清除之前下載的數據,清除方法是選擇“Cart”,然后點擊右下角的“Remove From Cart”。

4.“Cart”里面的內容清除之后,返回“Repository”,開始選擇需要下載的樣品信息“Cases”和需要下載的文件“Files”。

5.這里我們以乳腺癌為例,下載轉錄組信息,首先選擇樣品信息“Cases”,我們這里選擇的乳腺癌的所有信息,如果需要下載針對性的臨床信息可以在下拉框中自行選擇

6.然后選擇需要下載的文件“Files”,這里也可以再下拉框中根據自己需要的格式進行下載

7.然后將文件添加到“Cart”, 即點擊“Add All Files to Cart”

8.總共篩選出1222個乳腺癌轉錄組數據的樣本信息,進入“Cart”頁面,選擇要下載的格式進行下載

這樣我們的轉錄組數據信息就下載完成了,小伙伴們如果想要學習其他數據庫的使用,請持續(xù)關注呦!