調節失調的microRNAs(miRNAs)與腫瘤的進展、轉移和預后不良有關。MIR106A-5p在細胞遺傳學上定位于Xq26.2,在不同的癌癥中作為癌基因和抑癌基因。然而,MIR106A-5p致癌作用的調控機制尚未闡明。今天小編為大家帶來發表于“Autophagy”上的文章:“MIR106A-5p upregulation suppresses autophagy and accelerates malignant phenotype in nasopharyngeal carcinoma”,給大家詳細介紹MIR106A-5p如何參與鼻咽癌(NPC)進展。
我們使用miRNA芯片來表征鼻咽癌組織中MIR106A-5p的表達水平,通過臨床資料確定MIR106A-5p與患者預后的關系,后續實驗證實了MIR106A-5p在鼻咽癌中調節惡性腫瘤和自噬的機制。最后,我們研究了MIR106A-5p是如何在NPC中上調的。
結果:
1.MIR106A-5p在鼻咽癌中的表達及臨床意義
我們使用聯合的GEO隊列數據庫檢測NPC miRNAs的表達譜。這些數據表明,在差異表達的miRNAs中,MIR106A-5p在鼻咽癌組織中顯著增加了4.8倍。qRT-PCR證實了MIR106A-5p在鼻咽癌組織中的過表達(圖1A)。此外,MIR106A-5p在鼻咽癌細胞系中的表達顯著增加,尤其是CNE-2和5-8F細胞系(圖1B)。其次, ISH顯示,臨床IV期NPC患者的MIR106A-5p過表達比臨床I-III期NPC患者更為突出(圖1C,D),這表明MIR106A-5p的失調可能與終末期NPC密切相關。生存率分析表明,MIR106A-5p高表達患者的臨床預后比MIR106A-5p低表達的患者差(圖1E)??偟膩碚f,這些發現表明鼻咽癌進展與MIR106A-5p上調有關。
2.MIR106A-5p加速鼻咽癌惡性表型的形成
我們采用斑馬魚和BALB/c小鼠動物模型檢測MIR106A-5p的體內功能。我們發現MIR106A-5p的敲除顯著抑制了CNE-2細胞的轉移能力(圖2A,B)。MIR106A-5p敲除后鼻咽癌細胞的遷移減少(圖2C,D)。在皮下注射高或低MIR106A-5p表達的CNE-2細胞后測量腫瘤大小,注射MIR106A-5p低表達細胞的小鼠腫瘤生長減少(圖2E,F)。這些發現共同提供了MIR106A-5p加速鼻咽癌轉移和生長的證據。IHC分析顯示,低表達MIR106A-5p的異種移植可增加MAP1LC3B的表達水平(圖2F,G),MAP1LC3B的表達水平與鼻咽癌異種移植瘤中MKI67(增殖標記物ki-67)的表達呈負相關(圖2H)。
3.MIR106A-5p抑制鼻咽癌細胞自噬
我們假設MIR106A-5p表達失調可能影響自噬。因此,我們評價了MIR106A-5p對自噬體和自溶體生成的影響。值得注意的是,沉默MIR106A-5p的表達顯著促進了ATG基因的表達,并誘導自噬通量產生自噬體和/或自溶體(圖3A,I),這表明MIR106A-5p能有效地抑制鼻咽癌細胞的自噬。
4.MIR106A-5p通過抑制自噬作用加速鼻咽癌惡性表型
通過評估ATG5基因敲除后細胞的生長和遷移能力,研究了MIR106A-5p抑制的自噬在鼻咽癌發生和轉移中的作用。敲除ATG5顯著降低MIR106A-5p抑制誘導的自噬(圖4A)。由于三維細胞培養模型更接近體內腫瘤微環境,因此三維NPC細胞培養被用來評估細胞的活性和增殖。沉默MIR106A-5p表達可減少球體的形成和細胞生存能力,這個表型部分地被抑制ATG5所挽救(圖4B)。此外,在ATG5被抑制后,MIR106A-5p海綿體內誘導的轉移和生長減少被消除(圖4C-E)。這些發現表明MIR106A-5p抑制的自噬加速了惡性鼻咽癌的表型(圖4F)。
5.BTG3是MIR106A-5p的直接靶點,與頭頸部癌預后不良相關
通過四種常見的生物信息學工具來確定MIR106A-5p的自噬相關靶點(圖5A,B)。在這些靶基因中,BTG3具有MIR106A-5p潛在的高親和力結合位點(圖5C)。熒光素酶報告分析顯示MIR106A-5p和BTG3 3′-UTR之間具有生物有效相互作用(圖5D)。此外,鼻咽癌組織中BTG3 mRNA和BTG3蛋白表達降低(圖5E)。有趣的是,在MIR106A-5p抑制后,BTG3蛋白水平顯著增加,而BTG3的mRNA水平保持不變(圖5F-I)。鼻咽癌組織芯片中MIR106A-5p表達與BTG3蛋白水平呈負相關(圖5J)。這些結果表明MIR106A-5p可能通過翻譯抑制來調節BTG3的表達。最后,Kaplan-Meier分析顯示,在鼻咽癌組織芯片中,低BTG3水平與較差的臨床結果相關(圖5K)??偟膩碚f,這些數據表明MIR106A-5p通過靶向BTG3直接調節自噬。
6.BTG3對MIR106A-5p抑制自噬是必不可少的
通過用siRNA轉染鼻咽癌細胞,我們發現BTG3參與了MIR106A-5p相關的自噬抑制(圖6A-E)。一系列分析表明,BTG3的敲除消除了MIR106A-5p抑制增加自噬的能力(圖6A-E),證明MIR106A-5p抑制自噬依賴于其降低BTG3水平的能力。
7.BTG3對MIR106A-5p加速惡性鼻咽癌表型至關重要
為了進一步證實MIR106A-5p-BTG3軸導致惡性腫瘤加速,對MIR106A-5p海綿處理的鼻咽癌細胞進行慢病毒BTG3 shRNA轉導。MIR106A-5p抑制降低了鼻咽癌細胞的轉移和生長,但這些作用在BTG3基因敲除后顯著降低(圖7A-E)。IHC分析顯示,惡性表型加速的鼻咽癌異種移植組的自噬也減少(圖7F-K),這表明MIR106A-5p的自噬抑制和促腫瘤作用需要BTG3(圖7L)。
8.MIR106A-5p-BTG3軸通過MAPK途徑抑制自噬
接下來,我們試圖確定參與MIR106A-5p誘導自噬的BTG3相互作用蛋白。我們對MIR106A-5p靶點進行KEGG途徑分析后,確定了MAPK和AKT-MTOR通路。因此,使用這些途徑的抑制劑進行拯救實驗來研究這些途徑對MIR106A-5p-BTG3介導的腫瘤進展的相對貢獻。我們發現,只有用PD184352抑制MAP2K1/MEK活性才能顯著抑制由MIR106A-5p和BTG3沉默誘導的細胞增殖和遷移;相比之下,MK2206抑制AKT活性未能改變MIR106A-5p-BTG3介導的腫瘤生長和遷移(圖8A-D)。此外,我們還檢測了鼻咽癌的MIR106A-5p-BTG3軸依賴性自噬抑制是否由MAPK信號的激活引起。當MIR106A-5p抑制或BTG3表達激活自噬時,p-MAP2K1和下游p-MAPK1/ERK和p-MTOR水平降低。在用PD184352抑制MAP2K1活性后,MIR106A-5p和BTG3敲除細胞中的p-MAP2K1、p-MAPK1和p-MTOR水平和ATG表達被挽救(圖8E),這表明激活的MAPK信號部分負責NPC中MIR106A-5p-BTG3軸抑制自噬。
9.鼻咽癌中MIR106A-5p上調是EGR1和SOX9增加反式激活的結果
我們檢查了MIR106A-5p在鼻咽癌中是如何上調的。對MIR106A-5p啟動子的序列分析確定了EGR1和SOX9分別位于?136和?1472處(圖9A),表明EGR1和SOX9調節MIR106A-5p的轉錄。值得注意的是,在鼻咽癌細胞系中,EGR1和SOX9均上調(圖9B)。沉默EGR1和SOX9表達降低MIR106A-5p水平,并且EGR1和SOX9的過表達增加了MIR106A-5p水平(圖9C-E)。此外,熒光素酶報告分析和染色質免疫沉淀分析表明,EGR1和SOX9都直接與MIR106A-5p啟動子的預測結合位點結合,并反式激活MIR106A-5p(圖9F-H)。應用IHC和ISH法對鼻咽癌組織中SOX9和MIR106A-5p表達的相關性表明,SOX9的表達與MIR106A-5p水平呈正相關(圖9I)。鼻咽癌生存分析組織微陣列進一步顯示,與低表達SOX9的鼻咽癌患者相比,SOX9高表達患者的預后較差(圖9J)。GEO和TCGA數據庫分析也證實了這些預測結果(圖9K)。這些結果表明MIR106A-5p在鼻咽癌中的過表達是由于EGR1和SOX9增加了反式激活。
結論:
本研究揭示MIR106A-5p在鼻咽癌自噬和促進惡性表型中的作用。在鼻咽癌中,MIR106A-5p通過靶向BTG3和激活自噬調節MAPK信號通路促進惡性表型。我們的結果表明MIR106A-5p的定量在治療前預測復發率和生存率是有用的。綜上所述,我們的發現可以為自噬相關鼻咽癌治療的臨床應用提供新的見解。