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證據證據證據!外泌體circUHRF1抑制自然殺傷細胞功能

欄目:最新研究動態 發布時間:2020-09-03
自然殺傷細胞(NK)在天然抗腫瘤免疫反應中發揮重要作用。近年來,NK細胞功能障礙在包括肝癌在內的多種惡性腫瘤中得到證實...

    自然殺傷細胞(NK)在天然抗腫瘤免疫反應中發揮重要作用。近年來,NK細胞功能障礙在包括肝癌在內的多種惡性腫瘤中得到證實。然而,NK細胞功能障礙在人HCC中的分子生物學機制尚不清楚。本文部分回答了該問題:HCC來源的外泌體通過誘導NK細胞上TIM-3的表達抑制IFN-γTNFα的產生。本文于2020年6月27日發表在《Molecular cancer》期刊上。
技術路線:

主要結果:
1、HCC組織中UHRF1相關circRNA的分析
    UHRF1通常在HCC進展中上調表達,此外,circRNA是pre-mRNAs的反向剪切產物且通常被認為是癌細胞中pre-mRNAs剪切的副產物。一般來說,circRNAs的水平通常與各自的mRNA水平一致,因此,作者檢測了UHRF1來源的14種circRNA的表達水平(Fig.1A),其中hsa_circ_0048677 (circUHRF1)的表達最豐富且在HCC中顯著上調(Fig.1B)。進一步地,作者發現circUHRF1的表達在癌中顯著高于癌旁組織,且circUHRF1高表達的病人具有更大的腫瘤體積,血液中NK細胞含量更低,更多的微血管入侵以及更差的預后(Fig.1C-I)。

圖1 circUHRF1在HCC組織中上調表達

2、HCC細胞以外泌體方式分泌circUHRF1
    前人的研究表明可以通過外泌體在細胞間運輸,因此,作者猜測circUHRF1可能被HCC細胞轉運至其它細胞,為了驗證這個猜想,作者從HCC細胞系上清中分離鑒定到外泌體(Fig.A-B)。結果發現circUHRF1在六種HCC細胞系和對應的外泌體中的表達趨勢一致,且HCCLM3和SMMC-7721細胞系及其外泌體中的表達顯著高于其它細胞系(Fig.C-D)。此外,檢測發現circUHRF1存在與血漿中,并且HCC病人中血漿外泌體circUHRF1顯著高于健康志愿者,接受腫瘤切除術的病人外泌體circUHRF1含量降低,腫瘤逃逸的病人外泌體circUHRF1含量升高,這些結果說明血漿外泌體circUHRF1主要有HCC細胞產生(Fig.E)。有趣的是,有免疫逃避機制的患者血漿外泌體circUHRF1水平顯著升高,外周血NK細胞比例降低(Fig.F)。這表明血漿外泌體circUHRF1可以作為NK細胞相關免疫逃逸的關鍵分子決定因素。

圖2 circUHRF1的表達及特性

3、HCC細胞抑制NK細胞功能通過外泌體circUHRF1
    為了確定HCC細胞的外泌體circUHRF1是否誘導改變異種NK細胞,作者將6個健康供體的NK細胞和HCCLM3和SMMC-7721細胞系以對等比例共培養24小時,結果發現,與單獨培養NK細胞相比,共培養后細胞IFN-γ和TNFα的分泌顯著受損(Fig.3A-C)。此外,NK細胞和HCCLM3和SMMC-7721細胞系共培養后顯著增加了circUHRF1表達,但是這種增加被外泌體抑制劑GW4869抑制(Fig.3D-E)。不僅如此,加入外泌體抑制劑后NK細胞中IFN-γ和TNFα的分泌在是否與HCC細胞共培養的組間沒有表現出差異(Fig.3F-G)。此外,circUHRF1沉默后HCCLM3和SMMC-7721細胞外泌體中circUHRF1的表達顯著下降,而IFN-γ和TNFα的分泌顯著升高(Fig.3H-J)。上述結果表明HCC來源的外泌體circUHRF1損傷NK細胞的功能。

圖3 外泌體表達circUHRF1抑制NK細胞的功能

4、在NK細胞中,circUHRF1和miR-449c-5p相互降解
    作者進一步探究circUHRF1在NK-92細胞中可以結合miRNA,通過StarBase v3.0分析,預測到14個潛在的靶miRNAs。使用circUHRF1特異性和NC探針進行體內circUHRF1沉淀,然后檢測circUHRF1復合物中14個靶miRNAs的表達。實驗發現,復合物中顯著富集miR-449c-5p,而其它則少有富集(Fig.4A)。然后,在NK-92細胞中使用anti-AGO2抗體進行RIP實驗,結果發現circUHRF1和miR-449c-5p在anti-AGO2抗體中顯著富集,這些結果表明circUHRF1可能是miR-449c-5p和AGO2的結合平臺(Fig.4B)。為了進一步驗證這個結果,進行了生物素標記的miR-449c-5p的pulldown實驗,結果表明與NC相比,circUHRF1顯著富集(Fig.4C)。熒光素酶實驗結果顯示,與NC相比,miR-449c-5p顯著降低了野生型circUHRF1的熒光素酶活性,但對突變型的沒有影響(Fig.4D-E)。有趣的是,circUHRF1的表達水平可以被過表達miR-449c-5p顯著抑制,反過來,miR-449c-5p的表達也可以被過表達circUHRF1顯著抑制(Fig.4F-G)。這些結果表明circUHRF1和miR-449c-5p相互靶向結合。

圖4 circUHRF1抑制miR-449c-5p在NK細胞中的生物學功能

5、circUHRF1上調TIM-3的表達通過抑制miR-449c-5p活性
    通過上述實驗結果,作者猜測circUHRF1可能通過miR-449c-5p海綿上調其靶點的水平進而增強HCC病人的免疫逃逸。為了驗證這個猜想,作者首先分析了NK細胞中miR-449c-5p靶點的表達水平,包括TIM,然后使用熒光素酶實驗進一步驗證miR-449c-5p與TIM的結合(Fig.5A-B)。強制表達miR-449c-5p后,TIM的表達顯著下降(Fig.5C-D)。此外,circUHRF1的表達與miR-449c-5p的表達負相關,與TIM的表達呈正相關,miR-449c-5p的表達也與TIM的表達呈負相關(Fig.5E-G)。以上研究結果表明circUHRF1/miR-449c5p/TIM-3軸聯合作用影響NK細胞的功能。

圖5 在NK細胞中,circUHFR1調控miR-449c-5p/ TIM-3通路

6、circUHFR1以NK細胞依賴的方式誘導HCC的進展
    慢病毒載體pLO5-ciRcircUHRF1顯著提高了細胞和外泌體中circUHFR1的表達,以及NOD/SCID小鼠模型體內的肺轉移結節(Fig.6A-C)。此外,過表達circUHFR1具有肺轉移的小鼠體內血漿外泌體circUHFR1的含量顯著升高,而NKG2D陽性細胞數量顯著下降(Fig.6D-E)。這些結果表明circUHFR1以依賴外泌體和NK細胞的方式促進HCC進展。

圖6 circUHRF1以NK細胞依賴的方式誘導免疫逃逸

7、circUHRF1增強HCC對抗PD1治療的耐藥性
    鑒于強制表達circUHRF1抑制NK細胞的功能,所以接下來作者評估過表達circUHRF1是否會進一步阻礙anti-PD1的抗腫瘤作用。作者回顧性分析了30例在免疫治療前2-36個月行肝切除術并接受抗PD1免疫治療的復發遠處轉移(包括肺轉移)的HCC患者的資料。6個治療周期后,評估CT療效。結果發現3個病人表現部分響應(PR),7個病人表現穩定疾病(SD),20個病人表現進行性疾病。進一步研究發現circUHRF1的表達水平在PD組顯著高于SD組和PR組,而NKG2D陽性細胞數量在PD組顯著低于SD組和PR組,兩者呈現負相關性(Fig. 7A-C)。
    為了進一步評估circUHRF1對anti-PD1治療耐藥的影響,建立了皮下植入circUHRF1敲低的HCCLM3細胞或陰性對照細胞的異種移植模型。結果表明注射circUHRF1敲低的HCCLM3細胞導致小鼠對anti-PD1治療敏感且總體生存率升高(Fig. 7D-F)。這些結果表明強制表達circUHRF1可能妨礙HCC對anti-PD1治療的響應,靶向circUHRF1可能是恢復HCC對anti-PD1治療敏感性的有效方法。

圖7 在HCC患者中,高水平的circUHRF1與anti-PD1治療的耐藥性相關

    總之,本文證明HCC來源的外泌體通過誘導NK細胞上TIM-3的表達抑制IFN-γ和TNFα的產生。還報道了腫瘤外泌體通過外泌體circUHRF1抑制NK細胞功能的新機制,為HCC細胞和NK細胞的相互干擾提供了新的證據。
參考文獻:

Zhang Peng-Fei., Gao Chao., Huang Xiao-Yong., Lu Jia-Cheng., Guo Xiao-Jun., Shi Guo-Ming., Cai Jia-Bin., Ke Ai-Wu.(2020). Cancer cell-derived exosomal circUHRF1 induces natural killer cell exhaustion and may cause resistance to anti-PD1 therapy in hepatocellular carcinoma. Mol. Cancer, 19(1), 110. doi:10.1186/s12943-020-01222-5