長非編碼RNA(lncRNA)參與各種生物學和病理學過程。乙型肝炎病毒(HBV)是一種具有部分雙鏈的DNA病毒,可發展為慢性肝炎、肝硬化和肝細胞癌的危險因素。最近報道表明,某些lncRNA在HBV相關疾病中起著重要作用。lncRNA與病毒感染的研究套路你曉得嗎?這篇文章為您揭曉。
思維路線:
結果:
1. HBV感染誘導lncRNA HOTTIP上調
HBV(+)HCC組織和HCC細胞中HOTTIP的水平明顯升高,HBV初次感染后HOTTIP升高,而繼發感染后HOTTIP升高更多。這些結果表明,HOTTIP在HBV陽性組織和細胞中上調。
2. HBV DNA聚合酶通過CREB1誘導HOTTIP表達
將HOTTIP啟動子克隆到螢光素酶報道載體(HOTTIP-LUC +)中,熒光活性因pHBV1.3的存在而增加,pHBV1.3還增加HOTTIP的mRNA水平,HBV DNA pol(DNA聚合酶)可顯著增加HOTITP的mRNA水平。將HOTTIP啟動子與表達不同HBV蛋白質的質粒共轉染Huh7細胞,檢測它們對HOTTIP表達的影響,發現HBV DNA pol確實增加HOTTIP啟動子活動,其他效果不明顯。推定兩個CREB1結合位點存在于HOTTIP啟動子區域,Hueb7細胞中CREB1的過表達激活HOTTIP啟動子,突變CREB1的結合位點時,HOTTIP-Luc熒光活性被削弱。CREB1的異位表達增加Huh7細胞中HOTTIP mRNA的水平。HBV DNA pol可消除CREB1突變對HOTTIP啟動子活性的促進作用。轉錄抑制劑Dactinomycin D處理Huh7細胞后,CREB1 mRNA的穩定性增強,提示HBV DNA pol對CREB1的上調可能是由于CREB1 mRNA穩定性增加。這些表明HBV DNA pol綁定并穩定CREB1 mRNA以促進其翻譯,進而誘導HOTTIP表達。
3. HOTTIP和HBV DNA pol抑制HBV復制
研究HOTTIP對HBV基因表達和復制的影響。螢光素酶報告基因檢測表明,過表達HOTTIP抑制HBV Enh I / Xp活性,HOTTIP敲低則增加;但是,HBV SP1,Sp2和CP的活性沒有明顯變化。培養上清液中的HBsAg和HBeAg水平在HOTTIP過表達后減少,在HOTTIP敲低后增加。HOTTIP過表達的細胞中HBV pgRNA和總RNA減少,上清液中HBV DNA拷貝減少,DNA復制中間產物也減少。在HOTTIP敲低后效果相反。這些結果證明HBV DNA pol促進HOTTIP表達,并且HOTTIP反過來會抑制HBV復制。HBV DNA pol的過表達顯著降低HBsAg和HBeAg的水平,降低pgRNA、總RNA和HBV DNA拷貝。這些表明HOTTIP和HBV DNA pol可抑制HBsAg和HBeAg的產生以及HBV基因組復制。
4. HOXA13表達與HBV復制有關
將pHBV1.3質粒轉染到Huh7細胞中,HOXA13水平升高。HOXA13敲低可提高pHBV1.3轉染的Huh7中HBsAg、HBeAg的水平、HBV DNA拷貝水平。HOXA13抑制HBV Enh I / Xp活性,而敲低HOXA13則增強。HOXA13降低DNA復制中間體的水平。這些表明HOXA13抑制HBsAg、HBeAg的產生和HBV基因組復制。
5. HOXA13通過與HBV Enh I / Xp結合來介導HOTTIP對HBV復制的影響
HOTTIP可通過促進肝細胞中HOXA13的表達發揮其功能。HOTTIP過表達導致HOXA13蛋白質和mRNA積累,敲除HOTTIP具有相反作用。探討HOXA13促進HBV基因表達復制的機制,發現HOXA13過表達抑制HBV Enh I / Xp活性,突變HOXA13結合位點消除對HOTTIP和HOXA13對Enh I / Xp活性的刺激作用。這些證明HOXA13通過直接綁定到Enh I / Xp以介導HOTTIP對HBV病毒蛋白產生和復制。