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9分SCI文章——tRF高通量測序

欄目:最新研究動態 發布時間:2020-03-04
近年來,非編碼RNA研究熱潮興起,隨著研究的不斷深入,非編碼RNA的高分文章要求也就越來越高......

   近年來,非編碼RNA研究熱潮興起,隨著研究的不斷深入,非編碼RNA的高分文章要求也就越來越高。然而,近日一篇測序為主的非編碼RNA文章出現在了9分的雜志中。我們來看看是如何做到的吧:

   研究者的研究對象是非編碼RNA—tRF,一類相對來說少有研究的small RNA。研究者以tsRNA為切入點,發現在慢性淋巴細胞性白血病(CLL)中tsRNA ts-43、ts-44相對于正常B細胞中下調了3-5倍,這兩個tsRNA均來自pre-tRNA His,而 tRNA His的tRF-5片段也顯著下調。因此,研究者對CLL中成熟tRF表達水平進行了研究。
一、small RNA測序:研究侵襲性、惰性CLL中tsRNA
1.對測序數據進行分析,篩選出差異表達的tsRNA,結果如下圖所示:

2.q-PCR驗證tsRNA在臨床樣本中的表達



二、ts-43、ts-44前體tRF-5表達下調


三、根據small RNA測序數據,結合q-PCR分析成熟tRF表達情況
1.對測序數據進行分析:CLL tRF表達與正常B細胞的確存在差異

2.q-PCR在臨床樣本中進行驗證

   綜上,研究者得出結論:成熟的tRF可能在CLL中行使致癌/抑癌的功能。
   高通量測序、非編碼RNA的研究在如今的科研中已相對“尋常”,但尋找一個相對較新的非編碼RNA分子(如tRF、snoRNA)仍有可能發高分文章。