Trastuzumab是HER2陽性(HER2+)乳腺癌的標準治療藥物,但是一些病人不接受該藥物治療。MicroRNAs (miRNAs)已被用于預測對各種癌癥的治療效果當中,但是miRNAs是否可以作為HER2+轉移性乳腺癌(MBC)患者的生物標志物目前還不清楚。廣州中山大學宋爾衛教授領導的團隊在Nature Communications(IF= 12.353)上發表了題為“A serum microRNA signature predicts trastuzumab benefit in HER2-positive metastatic breast cancer patients”的新成果。該研究利用miRNA芯片,在對Trastuzumad反應明顯的HER2+ MBC患者血清中鑒定了13個差異表達的miRNAs,并選取其中4個miRNAs構建了一個用LASSO模型預測生存的標記。此外,他們的數據顯示,miR-940主要來自腫瘤細胞,而miR-451a、miR-16-5p和miR-17-3p主要來自免疫細胞。這4種miRNAs都直接作用于在Trastuzumab抗性中發揮關鍵作用的信號分子。綜上所述,他們開發了一種基于血清的miRNA標志物,它可以預測Trastuzumab對HER2+ MBC患者的治療效果,并保證未來臨床試驗的有效性。
技術路線:
研究結果:
1. 基于基因芯片分析獲得13個miRNA,并進一步選取獲得4個miRNA。
圖1 構建基于4個miRNA的標志物
(a) HER2+ MBC中13個血清miRNA表達水平的層次聚類。以Trastuzumab敏感患者61例(綠色)和Trastuzumab抗性患者42例(棕色)為分析對象,(b) 分級聚類顯示了13個候選miRNAs的共線性關系。(c) HER2+ mbc血清中相關miRNAs的LASSO系數,篩選獲得4個miRNAs。(d) 55例健康志愿者獻血者、134例Trastuzumab抗性患者、252例Trastuzumab敏感患者血清中4個miRNAs的表達水平。
2. 根據4個miRNA計算求得risk score,發現在不同組別低risk score有更好的PFS、OV。
圖2 Trastuzumab治療的Risk score和反應狀態在3組人群(包括對照組、化療和Trastuzumab結合治療組,化療組)中的分布情況
(a) Risk score和個體患者的反應狀態。(b) 3組中的高、低分人群的ORR比較。(c) 3組中高、低分人群的OS比較。(d) 3組中高、低分人群的PFS比較。
3. 4種miRNA是獨立的預后標記物。
表2 結合2組患者的臨床病理特征(OS和PFS),對4-miRNA標記物進行單變量和多變量Cox回歸分析
4. 利用其他臨床病理所獲得的risk score獨立于PFS.
圖3 基于臨床病理特征對PFS的預測的Foeest plot(Cox模型)
5. 結合4-miRNA求得risk score和遷移指標,對病人Trastuzumab敏感性有更好的評估結果。
圖4 ROC曲線和AUC值分析
(a-c) 基于時間依賴性的ROC曲線,評估4-miRNA標記物預測準確性。(d-f) 利用4-miRNA標記物、轉移位點等不同條件,比較對Trastuzumab治療反應預測準確性。
6. 低risk sore和 Trastuzumab治療組有最好的OS、PFS,顯示4-miRNA可作為Trastuzumab治療的預測marker。
圖5 利用Kaplan-Meier生存分析方法,區分HER2+ MBC患者為接受化療組和驗證組(根據4-miRNA標記物所求得risk score和曲妥單抗治療與否),進行OS和PFS分析。
7. miR-940主要在癌細胞高表達,而miR-451a、miR-16-5p、miR-17-3p免疫細胞里表達較高。
圖6 標記的來源
(a) 分離培養上清液中EV和EV-free上清液的策略。(b) EVs中CD63和Alix的Western blot分析。(c) 電鏡觀察純化的EV。(d) 5例病人不同細胞中的EV和EV-free上清液中的miRNA的相對表達水平。
8. PTEN、IGF1R和SRC分別是miR-940、miR-451a/miR-16- 5p和miR-17-3p的靶基因。
圖7 Trastuzumab耐藥的生物標志物的作用機制
(a-d) 用nc、ASO或4種miRNA mimic轉導SKBR3和BT474,然后將曲妥珠單抗(10μg/ ml)加入培養基中,培養3天,用MTS法比較細胞增殖/凋亡。(e) TargetScan 和Target的4種miRNA的target基因。(f-i) 分析4種預測的target基因野生型和突變體(3'UTR突變)與miRNA mimic的結合情況。
參考文獻:Li H1, Liu J2,3, Chen J2,3, Wang H4, Yang L2,3, Chen F2,3, Fan S2,3, Wang J1, Shao B1, Yin D2,4, Zeng M4, Li M5, Li J5, Su F2,3, Liu Q2,3, Yao H2,3, Su S6,7, Song E8,9,10,11. A serum microRNA signature predicts trastuzumab benefit in HER2-positive metastatic breast cancer patients.Nat Commun. 2018 Apr 24;9(1):1614. doi: 10.1038/s41467-018-03537-w