三陰性乳腺癌中isomiRs和tRFs的作用研究
Telonis AG and Riqoutsos I. Race disparities in the contribution of miRNA isoforms and tRNA-derived fragments to triple-negative breast cancer. Cancer Research, 2017. IF=9.122
三陰性乳腺癌（TNBC）是在白人和黑人婦女之間存在標志性差異的一種乳腺癌亞型。作者系統分析了TCGA數據庫的數據集，以研究ncRNAs調控mRNA的表達模式。作者研究了isomiRs和tRNA來源的片段（tRFs）。在正常的乳房組織中，作者發現在ncRNA和mRNA層面以及二者之間的關聯層面都有顯著性的結合作用。這種結合作用在TNBC中廣泛地被打斷：很多的mRNAs在正常乳房組織和伴有轉錄本或tRF失調的TNBC中差異表達。在TNBC患者中，isomiRs和tRFs參與的調節通路在不同種族間是不同的。來源于特定的miRNA基因位點和tRNA基因位點的多樣的isomiRs和tRFs與TNBC中存在的種族差異具有相關性。作者重點研究了種族特異的轉錄組，并挑選了差異表達的關鍵通路中的新陳代謝相關的MAPK通路和Wnt/β信號通路進行詳細研究。
研究路線：
 
研究結果：
 
 
 
圖1復合的種族和國家特異性轉錄組圖。
 
 
圖2 mRNA及其臨近基因的表達譜。
 
 
 
圖3 短的ncRNA和轉錄因子可解釋mRNA與種族的相關性。
 
 
 
圖4 isomiRs和tRFs可能是mRNA差異表達的誘因。
 
 
圖5 種族特異的與新陳代謝相關的基因及通路。

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