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外泌體miR-101-3p和miR-423-5p通過靶向FOXP4和EZH2抑制成髓細胞瘤的發生

欄目:最新研究動態 發布時間:2021-12-01
外泌體microRNAs (miRNAs)與多種腫瘤的發展和進展有關;然而,它們是否于髓母細胞瘤(MB)的發生仍有待闡明。在此......


外泌體microRNAs (miRNAs)與多種腫瘤的發展和進展有關;然而,它們是否于髓母細胞瘤(MB)的發生仍有待闡明。在此,有研究發現外泌體miR-101-3pmiR-423-5p在兒童MB的發病中起重要作用,該研究于20217月發表在《Cell Death and Differentiation》,IF15.828


技術路線:


主要研究結果:

1.       MB患者血漿來源的外泌體中miR-101-3pmiR-423-5p水平上調,這些miRNA可通過外泌體轉移到腫瘤細胞中

在初步篩選中,使用超離心法從MB患者(n = 4)和年齡匹配的健康對照組(n = 4)的血漿中分離出外泌體。通過透射電子顯微鏡分析分離出的外泌體,以確定外泌體的平均大小和形態,顯示出典型的直徑為150 nm的雙層球形結構(1A)。通過western blot檢測了外泌體標志物CD9、CD63GM130的表達。分離的顆粒外泌體核心蛋白標記CD9CD63陽性,順式高爾基標記GM130陰性(1B)

通過miRNA-seq研究了血漿外泌體的miRNA表達譜。使用1.5倍的變化作為閾值來定義上調或下調的miRNA,與健康對照組相比,MB患者中有35miRNA上調,5miRNA下調(1C)。然后選擇p<0.05進一步縮小差異miRNAs的表達范圍,發現MB患者血漿來源的外泌體中miR-101-3pmiR-320b-3p、miR-20a-5pmiR-423-5p的表達高于健康對照組血漿來源的外泌體(1D)。通過實時定量PCR (qPCR)檢測了miRNA的表達水平。與健康對照組相比,MB患者血漿來源的外泌體中miR-101-3pmiR-423-5p的表達上調(1E)。另外,比較了MB患者和健康對照組外周血單個核細胞中miR-101-3pmiR-423-5p的表達,發現MB患者外周血單個核細胞中miR-101-3pmiR-423-5p的表達水平更高(1F)。

為了確定血漿來源的外泌體是否能轉移到受體腫瘤細胞,用從MB患者分離的PKH67標記的外泌體培養DaoyMB細胞系)細胞24小時。隨后的共聚焦顯微鏡分析證實癌細胞細胞質中存在PKH67標記的外泌體,這意味著外周血來源的外泌體可被腫瘤細胞內化(圖1G)。在使用來源于MB患者血漿的混合外泌體培養Daoy細胞后,miR-101-3pmiR-423-5p的表達水平均上調,而使用來源于健康對照血漿的外泌體培養后,未觀察到顯著變化(圖1H)。這些結果表明,miR-101-3pmiR-423-5p在來源于MB患者血漿的外泌體中富集,并可通過這些外泌體輸送到腫瘤細胞。


2. miR-101-3p和miR-423-5p在MB細胞中具有抑癌作用

使用CCK-8分析了miR-101-3pmiR-423-5pMB細胞增殖能力的影響。與對照組相比,DaoyD283 Med細胞中miR-101-3pmiR-423-5p的過度表達導致腫瘤細胞增殖率降低(圖2A,B)。通過CCK-8分析,進一步評估了添加來自MB患者血漿的外泌體(50μg/ml)對DaoyD283 Med細胞增殖的影響,結果表明,兩種細胞系的腫瘤細胞的增殖能力均受到顯著抑制(圖2C)。通過流式細胞術分析研究了miR-101-3pmiR-423-5p對細胞凋亡的影響。與陰性對照組相比,任一miRNA的過度表達導致DaoyD283 Med細胞的凋亡率顯著增加(圖2D,E)。

遷移和侵襲實驗發現,miR-101-3pmiR-423-5p的過度表達抑制Daoy細胞的侵襲和遷移能力(圖2F-H)。綜上所述,這些數據證實miR-101-3pmiR-423-5pMB細胞中發揮抗腫瘤作用,并且miRNA的上調可以抑制MB細胞增殖、遷移和侵襲,同時也促進細胞凋亡。


3. 單核細胞/巨噬細胞來源的外泌體miR-101-3p和miR-423-5p可轉入MB細胞

前面發現miR-101-3pmiR-423-5pMB患者血漿分離的PBMCs和外泌體中均上調(1E, F),而這兩種miRNAs在腫瘤組織中的表達均低于相鄰正常腦組織(3A)。這表明含有這兩種mirna的外泌體來自免疫細胞而不是腫瘤細胞,是對腫瘤的免疫反應的結果。巨噬細胞來源的外泌體占血液中循環微泡的很大比例。為了確定含有miR-101-3pmiR-423-5p的外泌體的來源,從THP-1單核細胞培養上清中分離出外泌體,并檢測miR-101-3pmiR-423-5p的表達。發現miR-101-3pmiR-423-5p在分離的外泌體中的表達高于THP-1細胞(3B)。用轉染miR-101-3p/miR-423-5p模擬物或miR-NCTHP-1細胞衍生的外泌體培養Daoy細胞,觀察到這些外泌體也可以轉移到Daoy細胞中,并且培養后miR-101-3pmiR-423-5p的表達水平較高(圖3C,D)。與對照組相比,來自轉染miR-101/miR-423模擬物的THP-1細胞上清液的外泌體顯著抑制Daoy細胞的增殖能力(圖3E)。進一步用轉染miR-101-3p/miR-423-5p模擬物或miR-NC(陰性對照)的THP-1單核細胞培養上清液培養Daoy細胞,發現Daoy細胞的增殖能力受到顯著抑制,而用含有GW4869的培養基培養后未觀察到顯著變化(40μM;一種抑制外泌體分泌的中性鞘磷脂酶抑制劑)(圖3F)。這些結果表明,對細胞增殖的影響至少部分是由于外泌體的存在,并且這些影響可以通過GW4869處理部分逆轉。與THP-1細胞類似, HMO6細胞也可以分泌含有miR-101-3pmiR-423-5p的外泌體(圖S4A D)和存在于MB組織中的CD68+細胞(圖3G)。從MB患者和健康對照組的外周血中分離出CD14+單核細胞,并將其培養72小時。與對照組相比,MB患者來源的CD14+單核細胞培養上清液中的外體miR-101-3pmiR-423-5p的表達更高(圖3H)。總之,這些結果表明MB患者的單核巨噬細胞分泌含有miR-101-3pmiR-423-5p的外泌體,這些外泌體可以轉移到MB細胞。


4. FOXP4是miR-101-3p和miR-423-5p的靶點

使用TargetScanRNA22預測工具確定了它們的潛在靶點。確定了6個在兩個數據庫中均被miRNA調控的基因作為潛在靶標進行評估,分別是FOXP4、PLCB1、ANKRD52、ANGPTL2、DLGAP3DCUN1D3(4A)。由于FOXP4 (forkhead box P4)已知在胚胎發育和腫瘤發生中有作用,因此選擇該基因進行進一步研究。經western blotting檢測,轉染miR-101-3pmiR-423-5pDaoy細胞顯示內源性FOXP4蛋白表達降低(4B, C)。此外,HEK293T細胞中的熒光素酶報告基因檢測顯示,這兩種miRNA的過表達均顯著抑制FOXP4-3’UTR驅動的熒光素酶活性;然而,miR-101-3pmiR-423-5p與突變的FOXP4-3’UTR共轉染后,熒光素酶活性未見顯著變化(4D)。這表明FOXP4可能是MBmiR-101-3pmiR- 423-5p的直接和功能靶點。


5. FOXP4在MB細胞中起致癌基因的作用

通過real-time qPCR檢測發現FOXP4MB腫瘤組織中的表達水平高于相鄰腦組織樣本(5A)。為了進一步闡明靶向FOXP4是否可以介導MB腫瘤進展,在Daoy細胞中進行了一系列功能檢測。使用siRNA抑制FOXP4表達(5B)導致細胞增殖、遷移和侵襲減少,而細胞凋亡率增加(5C-H)。綜上所述,這些結果表明FOXP4可能是MB腫瘤發生中的致癌基因,并且可能是miR-101-3pmiR-423-5p的靶點。



6. EZH2在MB腫瘤組織中上調,是miR-101-3p的功能靶點,在MB腫瘤進展中作為癌基因

由于在體外觀察到miR-101-3pDaoy細胞的抑制作用似乎強于miR-423-5p(2A)。這提示miR-101-3p也可能靶向FOXP4以外的基因。通過生物信息學分析,發現EZH2miR-101-3p的另一個假定靶點。

如圖6A所示,腫瘤組織中EZH2 mRNA的相對表達顯著高于鄰近正常組織。TargetScan數據庫中調查處EZH2 3’-UTR中存在miR-101-3p的匹配位點,并采用雙熒光素酶報告子分析來確認miR-101-3pEZH2表達水平之間的相關性。如圖6B所示,miR-101-3p模擬物的轉染降低了野生型EZH2 3’-UTR驅動的熒光素酶活性,而在以突變形式轉染后未觀察到顯著變化,這表明miR-101-3p可以通過直接結合其3’-UTR中的位點來抑制EZH2的表達。瞬時轉染miR-101-3p也降低了Daoy細胞中EZH2 mRNA和蛋白質水平(圖6CD)。

接下來,為了研究EZH2MB中的功能,同樣使用siRNA敲除其在Daoy細胞中的表達(6E)。功能分析顯示,EZH2的下調抑制MB細胞活力、遷移和侵襲,同時促進MB細胞凋亡(6F-K)。綜上所示,這些結果表明,miR-101-3p可以直接靶向EZH2FOXP4抑制MB。


7.     miR-101-3p或miR-423-5p過表達抑制體內腫瘤的發生

為了評估miR-101-3pmiR-423-5p在體內的抗腫瘤作用,將轉染LV16-miR-101-3p、LV16-miR-423-5pLV16-NC(陰性對照)的Daoy細胞(5 106)皮下注射到雄性Balb/c裸鼠體內,并每周測量產生的腫瘤體積。通過RT-qPCR測定轉染慢病毒的Daoy細胞中miR-101-3pmiR-423-5p的相對表達水平(圖7A)。注射后2周可觸及腫瘤,植入后7周處死小鼠(圖7B,C)。與對照組相比,LV16-miR-101-3pLV16-miR-423-5p治療組的腫瘤生長受到顯著抑制(圖7C,D)。如圖7E所示,使用miR-101-3pmiR-423-5p治療后,腫瘤重量也顯著降低。通過免疫組織化學評估了EZH2、FOXP4Ki-67在異種移植腫瘤組織中的表達。與對照組織相比,表達LV16-miR-101-3pLV16-miR-423-5p的腫瘤組織中FOXP4Ki-67的水平均下調(圖7F,G),而表達LV16-miR-101-3p的腫瘤組織中EZH2的水平也下調??傊@些數據表明miR-101-3pmiR-423-5p通過抑制FOXP4EZH2的表達來抑制體內腫瘤生長。


 
主要結論:

綜上所述,作者確定了兩種外泌體的miRNAs, miR-101-3pmiR-423-5p在體外和體內均是MB細胞增殖、遷移和凋亡的關鍵調控因子,并確定這些作用是通過與FOXP4-3’UTR直接結合而發揮的。進一步發現miR-101-3p也可以靶向EZH2。這些數據為MB的治療提供了一種新的治療策略(8)