鼻咽癌(鼻咽癌)是鼻咽部上皮性起源的惡性腫瘤,在中國南方和東南亞的發病率高達千分之二。然而,迄今為止,涉及鼻咽癌的發展,特別是轉移過程的分子機制仍不清楚。因此,需要進一步了解鼻咽癌的發病機制,以制定更有效的治療策略。環狀RNA (Circular RNAs, circRNAs)在人類細胞中廣泛表達,與癌癥的發展密切相關。越來越多的研究發現,circRNA在許多生命過程中具有重要作用,參與包括惡性腫瘤在內的許多人類疾病的發生。雖然已經鑒定出了許多環狀RNA,但絕大多數環狀RNA的功能仍不清楚,尤其是在NPC中。因此有作者報道相關內容,2021年發表在《Molecular Cancer》,IF:27.401。
技術路線:
主要研究結果:
1. CircRNF13在鼻咽癌臨床組織中低表達
為了獲得環狀RNA在NPC中的表達譜,作者對NPC細胞系5-8F(accession number: PRJNA391554)的下一代mRNA測序(RNAseq)數據進行了重新分析。在這些環狀RNA中,根據環狀區域的不同,分為五種類型:外顯子衍生環狀RNA、內含子衍生環狀RNA、反義鏈環狀RNA、義鏈環狀RNA重疊區和基因間環狀RNA(圖1A)。其中一種新的潛在環狀RNA, circRNF13,在NPC組織中高豐度表達,但circRNF13在NPE組織中的表達高于NPC組織(圖1B)。基于circRNF13剪接位點,作者認為circRNF13是由RNF13基因(NM_183381.2)的外顯子2-8環狀剪接形成的染色體 3q25.1,全長716 bp(圖1C)。核質分離檢測和RNA熒光原位雜交檢測顯示,circRNF13分布于細胞核和細胞質中,且更局限于細胞核。而RNase R(圖1D-E)處理顯示circRNF13在NPC細胞中比RNF13 mRNA更穩定(圖1F)。這些數據提示,circRNF13可能影響鼻咽癌的發育。
圖1 CircRNF13在鼻咽癌中低表達
為了探索circRNF13在NPC中的功能,構建了circRNF13過表達載體,并基于circRNF13的剪接位點設計了circRNF13-siRNA。MTT和菌落形成實驗表明,過表達circRNF13抑制鼻咽癌細胞增殖,敲低circRNF13促進鼻咽癌細胞增殖(圖2A, B)。流式細胞術結果也顯示,過表達circRNF13的細胞在G1期停滯,而抑制circRNF13的細胞數量在G2/M期增加(圖2C)。創面愈合實驗結果顯示,當circRNF13表達高時,鼻咽癌細胞的遷移能力顯著降低,而當circRNF13表達低時,鼻咽癌細胞的遷移能力顯著降低(圖2D)。Transwell實驗表明,過表達circRNF13抑制鼻咽癌細胞的侵襲,而下調circRNF13則促進了侵襲(圖2E)。基于這些觀察,得出circRNF13抑制鼻咽癌細胞增殖、遷移和侵襲的結論。
圖2 CircRNF13抑制NPC的增殖、遷移和侵襲
3. CircRNF13在體內抑制鼻咽癌生長和轉移
接下來,作者研究了circRNF13在體內對鼻咽癌細胞增殖和轉移的影響。皮下成瘤實驗結果顯示,過表達circRNF13的裸鼠皮下腫瘤較小,而circRNF13敲低組皮下腫瘤較大(圖3A-C)。石蠟包埋、切片和免疫組化染色顯示,circRNF13過表達組Ki-67表達明顯低于circRNF13敲低組(圖3D)。尾靜脈肺轉移檢測結果顯示,circRNF13過表達組中肺結節數量明顯低于對照組,而circRNF13敲低組肺結節數量增加(圖3E-F)。肺結節的H&E染色也顯示,circRNF13過表達組鼻咽癌肺轉移的數量明顯低于circRNF13敲低組(圖3G)。綜上所述,circRNF13在體外和體內均有抑制鼻咽癌增殖和轉移的作用。
圖3 CircRNF13在體內抑制鼻咽癌生長和轉移
4. CircRNF13可能通過抑制糖酵解來抑制鼻咽癌的遷移和侵襲
為了研究circRNF13對鼻中癌增殖和轉移的分子機制,作者采用液相色譜-串聯質譜(LC MS/MS)對轉染sicircRNF13或擾亂siRNA的CNE2細胞進行了檢測。結果發現過表達circRNF13抑制了鼻咽癌細胞中的葡萄糖攝取和乳酸生成(圖4A)。海馬實驗顯示,過表達circRNF13導致CNE2和HNE2細胞的糖酵解能力顯著下降,而下調circRNF13則顯著增加糖酵解能力(圖4B)。Western blotting結果顯示,在鼻咽癌細胞中過表達circRNF13顯著上調磷酸化AMPKα,下調mTOR,進一步下調mTOR下游靶點pS6K和4EBP1的表達。另一方面,敲低circRNF13則會產生相反的效果(圖4C)。用糖酵解抑制劑2-DG阻斷糖酵解途徑。當添加糖酵解抑制劑2-DG時,抑制circRNF13并沒有下調磷酸化AMPKα(圖4D)。這一數據表明,敲低circRNF13可促進鼻鼻癌細胞的遷移和侵襲,添加2-DG后這種作用減弱(圖4E-F)。這些結果提示circRNF13可能通過抑制糖酵解來抑制鼻咽癌的遷移和侵襲。
圖4 CircRNF13抑制鼻咽癌細胞的糖酵解
5.CircRNF13通過促進鼻咽癌細胞糖酵解GLUT1泛素化
為了研究circRNF13調控鼻咽癌細胞糖酵解過程的分子機制,作者采用RT-PCR和western blotting在HNE2和CNE2細胞中檢測糖酵解途徑的主要分子GLUT1、LDHA和HK2。數據顯示,在circRNF13過表達時GLUT1蛋白水平顯著降低,而在circRNF13敲低時GLUT1蛋白水平顯著升高,而mRNA表達水平沒有顯著改變。CircRNF13在mRNA和蛋白水平上對LDHA和HK2的表達均有較弱的影響(圖5A, B)。這些數據表明,circRNF13可能主要通過調節GLUT1來調節糖酵解。Western blotting顯示,在circRNF13過表達時,GLUT1的穩定性降低,而在circRNF13敲低時,GLUT1的穩定性增加(圖5C)。通過抗泛素抗體證實,過表達circRNF13促進GLUT1泛素化,而敲低circRNF13則降低GLUT1的蛋白泛素化水平(圖5D)。這些結果表明,circRNF13可能通過調節泛素介導的GLUT1降解來抑制鼻咽癌細胞的糖酵解。
圖5 CircRNF13通過促進GLUT1泛素化抑制鼻咽癌細胞的糖酵解
6. CircRNF13通過直接結合SUMO2 mRNA的3’UTR來促進SUMO2的穩定性
為了確定circRNF13是否與SUMO2相互作用調節增殖、遷移和侵襲,作者進行了western blotting和RT-PCR,結果顯示,circRNF13過表達顯著誘導了SUMO2在RNA和蛋白水平上的表達。通過敲除circRNF13得到了相反的結果(圖6A, B)。生物信息學分析顯示,在circRNF13和SUMO2的3 -UTR之間存在一個連續的結合基元(圖6C)。RNA pull-down、雙熒光素酶實驗以及放線菌素D (2 μg/mL)檢測證明circRNF13通過與SUMO2的3 ’-UTR結合調控其表達。
圖6 CircRNF13直接結合并穩定SUMO2 mRNA,上調其表達
7. CircRNF13通過SUMO2促進GLUT1的泛素化
作者通過Co-IP實驗揭示了GLUT1和UBC9之間的相互作用(圖7A,B)。免疫熒光顯示了SUMO2和GLUT1蛋白的共同定位(圖7C)。為了了解SUMO2在鼻咽癌中的分子基礎,在HNE2和CNE2細胞中檢測了GLUT1在過表達或敲低circRNF13時的SUMOylation。Western blotting顯示,過表達circRNF13促進GLUT1的SUMOylation,敲低circRNF13抑制GLUT1的SUMOylation(圖7D)。為了確定SUMO2是否參與了circRNF13調控的GLUT1的泛素化,緊接著在鼻咽癌細胞中過表達了SUMO2。泛素化實驗表明,過表達SUMO2可加速GLUT1的泛素化(圖7E)。在sicircRNF13和SUMO2過表達載體共轉染的HNE2和CNE2細胞中,敲低circRNF13可減弱SUMO2誘導的GLUT1泛素化水平(圖7F)。這些數據表明,circRNF13通過與SUMO2結合調控GLUT1泛素化。
圖7 CircRNF13通過SUMO2促進GLUT1的泛素化
8. CircRNF13通過SUMO2抑制鼻咽癌細胞的增殖、遷移和侵襲
MTT法檢測circRNF13是否通過SUMO2抑制鼻咽癌細胞增殖、遷移和侵襲,結果顯示,過表達SUMO2挽救了circRNF13敲低介導的鼻咽癌細胞增殖能力的改變(圖8A)。傷口愈合和Transwell實驗顯示,SUMO2挽救了circRNF13敲低介導的鼻咽癌細胞遷移和侵襲能力的改變(圖8B, C)。海馬實驗也顯示,過表達SUMO2挽救了由circRNF13敲低引起的鼻咽癌細胞糖解應激的改變(圖8D)。小鼠組織中也進行了SUMO2和GLUT1的免疫組化,結果顯示,在circRNF13過表達組的裸鼠皮下腫瘤切片中,SUMO2低表達,而GLUT1高表達(圖8E)。circRNF13 作為腫瘤抑制因子,直接與 SUMO2 的 3’-UTR 結合并延長 SUMO2 mRNA 的半衰期。 SUMO2 的上調通過 GLUT1 的 SUMOylation 和泛素化促進 GLUT1 降解,其通過抑制糖酵解來調節 AMPK-mTOR 通路,最終導致 NPC 的增殖和轉移(圖 8F)。
圖8 CircRNF13通過SUMO2抑制鼻咽癌的增殖和轉移
結論:
新型 circRNF13 通過 circRNF13-SUMO2-GLUT1 軸在 NPC 的發育中發揮重要作用。 該研究表明circRNF13通過與SUMO2結合介導NPC糖酵解,為進一步闡明NPC的發病機制和靶向治療提供了重要的理論基礎。