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MAZTER-seq:不一樣的m6A研究方法

欄目:最新研究動態 發布時間:2019-10-12
m6A(N6-methyladenosine)是mRNA的修飾方式之一,在發育、生理和疾病中起關鍵作用......

m6A(N6-methyladenosine)是mRNA的修飾方式之一,在發育、生理和疾病中起關鍵作用。m6A的研究一直以來存在一個問題:m6A化學計量無法量化。接下來提到的方法很好的解決了這一問題。Garcia-Campos等人開發了MAZTER-seq,這一方法不僅可以從頭檢測m6A位點,對甲基化進行定量,還可以對亞細胞、不同類型細胞以及疾病不同狀態的m6A進行定量分析。
MAZTER-seq是基于一種RNA酶MazF。這種還酶特異性從頭切割無甲基化修飾的ACA位點,對酶處理過的片段經處理后進行反轉錄,對cDNA產物進行測序

對測序結果進行分析計算,量化m6A:

該方法的局限之一在于,只能識別ACA位點的甲基化,而ACA只占DRACH的16%左右。但無論如何,這一方法的發表推動了m6A研究領域的發展,為m6A的研究提供了新思路。