OCC-1是結直腸癌中最早注釋的lncRNA之一。然而,它的功能在很大程度上仍不為人所知。四川大學的研究人員研究發現OCC-1在結直腸癌中發揮致癌作用。在體內和體外試驗中,敲除OCC-1可促進細胞生長,這在很大程度上是由于其抑制G0到G1和G1到S期細胞周期轉變的能力。此外,過表達OCC-1可以抑制OCC-1敲除細胞的生長。癌癥相關的RNA結合蛋白HuR (ELAVL1)可以結合并穩定成千上萬的mRNA。OCC-1通過與HuR結合并破壞其穩定性而發揮作用。OCC-1增強了泛素E3連接酶β-TrCP1與HuR的結合,使HuR易受泛素化和降解的影響,從而降低HuR及其靶mRNA(包括與癌癥癌細胞生長直接相關的mRNA)的表達水平。這些發現揭示了lncRNA OCC-1可以通過調節RNA結合蛋白HuR的穩定性,在轉錄后水平上調節大量mRNA的表達水平。
研究路線圖:
研究結果:
圖1 OCC-1在結直腸癌中發揮致癌作用。(A)對兩組獨立的臨床樣本基因表達數據進行分析,發現在結直腸癌晚期腫瘤(T)期,OCC-1表達顯著下調。(B) RNA FISH發現OCC-1在Caco-2和HCT116細胞中主要分布于細胞質。(C) RT-qPCR分析顯示,在Caco-2和HCT116細胞中兩個獨立的shRNAs(RNA干擾片段)可有效降低OCC-1 RNA的水平。(D) CCK-8檢測顯示,在Caco-2和HCT116細胞中,OCC-1被敲除后細胞增殖顯著增加。(E) Ki67染色顯示,OCC-1敲除細胞中Ki67陽性增殖細胞的比例明顯高于對照組。(F) FACS分析顯示OCC-1敲除后,Caco-2細胞的細胞周期分布情況。(G)菌落形成實驗表明,OCC-1敲除細胞比對照細胞形成更多的菌落。
圖2體內敲除OCC-1促進結直腸癌細胞的生長。通過皮下注射OCC-1敲除細胞到BALB/c裸鼠的兩翼,進行成瘤實驗研究。
圖3在OCC-1敲除的細胞中過表達OCC-1抑制細胞生長。
圖4在Caco-2細胞系中,敲除OCC-1增加細胞生長相關基因的表達。
圖5OCC-1和HuR蛋白的作用關系。(A) RNA pull-down實驗和western blot證實HuR作為蛋白伴侶特異性結合OCC-1 3’UTR。EGFP RNA為RNA對照。ACTB和GAPDH是蛋白質對照。(B) RIP證實OCC-1與HuR在Caco-2細胞中的關系。GAPDH mRNA被用作non-HuR靶基因對照。(C) OCC-1型矯形器3’UTR的示意圖顯示了HuR的結合motifs。(D)維恩圖展示了OCC-1抑制基因顯著富集于早前的CLIP實驗確定的HuR靶基因集合中。大約74%的OCC-1抑制基因在芯片分析中也是HuR靶基因。(E) RIP實驗顯示,6個被選中的OCC-1抑制基因Caco-2細胞中也與HuR發生了相互作用。(F) RT-qPCR(左)和western blot(右)結果顯示靶向HuR的干擾片段顯著降低HuR的mRNA和蛋白表達水平。(G) RT-qPCR分析顯示,敲除HuR后,OCC-1和6個被選擇的OCC-1抑制基因的表達都下調。
圖6 OCC-1通過增強HuR與泛素E3連接酶β-TrCP1的結合,促進HuR的泛素化和降解。
1. Lan, Y., et al., Long noncoding RNA OCC-1 suppresses cell growth through destabilizing HuR protein in colorectal cancer. Nucleic Acids Res, 2018. 46(11): p. 5809-5821. (IF=11.561)